Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5W0

Atp6ap1l, ATPase, H+-transporting, lysosomal accessory protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6ap1lD3Z5W0 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp6ap1lD3Z5W0 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp6ap1lD3Z5W0 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp6ap1lD3Z5W0 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp6ap1lD3Z5W0 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp6ap1lD3Z5W0 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp6ap1lD3Z5W0 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp6ap1lD3Z5W0 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp6ap1lD3Z5W0 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp6ap1lD3Z5W0 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp6ap1lD3Z5W0 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp6ap1lD3Z5W0 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp6ap1lD3Z5W0 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp6ap1lD3Z5W0 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp6ap1lD3Z5W0 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp6ap1lD3Z5W0 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp6ap1lD3Z5W0 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp6ap1lD3Z5W0 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp6ap1lD3Z5W0 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp6ap1lD3Z5W0 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp6ap1lD3Z5W0 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp6ap1lD3Z5W0 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp6ap1lD3Z5W0 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp6ap1lD3Z5W0 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp6ap1lD3Z5W0 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp6ap1lD3Z5W0 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp6ap1lD3Z5W0 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp6ap1lD3Z5W0 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp6ap1lD3Z5W0 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp6ap1lD3Z5W0 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp6ap1lD3Z5W0 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp6ap1lD3Z5W0 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp6ap1lD3Z5W0 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp6ap1lD3Z5W0 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp6ap1lD3Z5W0 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp6ap1lD3Z5W0 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp6ap1lD3Z5W0 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp6ap1lD3Z5W0 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp6ap1lD3Z5W0 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp6ap1lD3Z5W0 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp6ap1lD3Z5W0 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp6ap1lD3Z5W0 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp6ap1lD3Z5W0 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp6ap1lD3Z5W0 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp6ap1lD3Z5W0 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp6ap1lD3Z5W0 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp6ap1lD3Z5W0 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp6ap1lD3Z5W0 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp6ap1lD3Z5W0 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp6ap1lD3Z5W0 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp6ap1lD3Z5W0 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp6ap1lD3Z5W0 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp6ap1lD3Z5W0 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp6ap1lD3Z5W0 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp6ap1lD3Z5W0 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp6ap1lD3Z5W0 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp6ap1lD3Z5W0 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp6ap1lD3Z5W0 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp6ap1lD3Z5W0 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp6ap1lD3Z5W0 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp6ap1lD3Z5W0 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp6ap1lD3Z5W0 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp6ap1lD3Z5W0 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp6ap1lD3Z5W0 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp6ap1lD3Z5W0 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp6ap1lD3Z5W0 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp6ap1lD3Z5W0 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp6ap1lD3Z5W0 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp6ap1lD3Z5W0 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp6ap1lD3Z5W0 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp6ap1lD3Z5W0 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp6ap1lD3Z5W0 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp6ap1lD3Z5W0 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp6ap1lD3Z5W0 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp6ap1lD3Z5W0 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp6ap1lD3Z5W0 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp6ap1lD3Z5W0 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp6ap1lD3Z5W0 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp6ap1lD3Z5W0 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp6ap1lD3Z5W0 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp6ap1lD3Z5W0 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp6ap1lD3Z5W0 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp6ap1lD3Z5W0 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp6ap1lD3Z5W0 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp6ap1lD3Z5W0 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp6ap1lD3Z5W0 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp6ap1lD3Z5W0 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp6ap1lD3Z5W0 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp6ap1lD3Z5W0 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms