Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5L4

5430403G16Rik, RIKEN cDNA 5430403G16 gene, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5430403G16RikD3Z5L4 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
5430403G16RikD3Z5L4 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
5430403G16RikD3Z5L4 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
5430403G16RikD3Z5L4 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
5430403G16RikD3Z5L4 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
5430403G16RikD3Z5L4 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
5430403G16RikD3Z5L4 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
5430403G16RikD3Z5L4 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
5430403G16RikD3Z5L4 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
5430403G16RikD3Z5L4 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
5430403G16RikD3Z5L4 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
5430403G16RikD3Z5L4 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
5430403G16RikD3Z5L4 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
5430403G16RikD3Z5L4 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
5430403G16RikD3Z5L4 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
5430403G16RikD3Z5L4 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
5430403G16RikD3Z5L4 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
5430403G16RikD3Z5L4 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
5430403G16RikD3Z5L4 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
5430403G16RikD3Z5L4 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
5430403G16RikD3Z5L4 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
5430403G16RikD3Z5L4 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
5430403G16RikD3Z5L4 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
5430403G16RikD3Z5L4 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
5430403G16RikD3Z5L4 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
5430403G16RikD3Z5L4 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
5430403G16RikD3Z5L4 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
5430403G16RikD3Z5L4 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
5430403G16RikD3Z5L4 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
5430403G16RikD3Z5L4 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
5430403G16RikD3Z5L4 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
5430403G16RikD3Z5L4 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
5430403G16RikD3Z5L4 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
5430403G16RikD3Z5L4 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
5430403G16RikD3Z5L4 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
5430403G16RikD3Z5L4 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
5430403G16RikD3Z5L4 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
5430403G16RikD3Z5L4 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
5430403G16RikD3Z5L4 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
5430403G16RikD3Z5L4 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
5430403G16RikD3Z5L4 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
5430403G16RikD3Z5L4 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
5430403G16RikD3Z5L4 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
5430403G16RikD3Z5L4 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
5430403G16RikD3Z5L4 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
5430403G16RikD3Z5L4 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
5430403G16RikD3Z5L4 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
5430403G16RikD3Z5L4 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
5430403G16RikD3Z5L4 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
5430403G16RikD3Z5L4 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
5430403G16RikD3Z5L4 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
5430403G16RikD3Z5L4 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
5430403G16RikD3Z5L4 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
5430403G16RikD3Z5L4 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
5430403G16RikD3Z5L4 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
5430403G16RikD3Z5L4 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
5430403G16RikD3Z5L4 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
5430403G16RikD3Z5L4 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
5430403G16RikD3Z5L4 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
5430403G16RikD3Z5L4 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
5430403G16RikD3Z5L4 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
5430403G16RikD3Z5L4 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
5430403G16RikD3Z5L4 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
5430403G16RikD3Z5L4 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
5430403G16RikD3Z5L4 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
5430403G16RikD3Z5L4 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
5430403G16RikD3Z5L4 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
5430403G16RikD3Z5L4 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
5430403G16RikD3Z5L4 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
5430403G16RikD3Z5L4 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
5430403G16RikD3Z5L4 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
5430403G16RikD3Z5L4 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
5430403G16RikD3Z5L4 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
5430403G16RikD3Z5L4 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
5430403G16RikD3Z5L4 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
5430403G16RikD3Z5L4 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
5430403G16RikD3Z5L4 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
5430403G16RikD3Z5L4 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
5430403G16RikD3Z5L4 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
5430403G16RikD3Z5L4 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
5430403G16RikD3Z5L4 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
5430403G16RikD3Z5L4 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
5430403G16RikD3Z5L4 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
5430403G16RikD3Z5L4 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
5430403G16RikD3Z5L4 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
5430403G16RikD3Z5L4 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
5430403G16RikD3Z5L4 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
5430403G16RikD3Z5L4 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
5430403G16RikD3Z5L4 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
5430403G16RikD3Z5L4 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
5430403G16RikD3Z5L4 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
5430403G16RikD3Z5L4 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
5430403G16RikD3Z5L4 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
5430403G16RikD3Z5L4 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
5430403G16RikD3Z5L4 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
5430403G16RikD3Z5L4 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
5430403G16RikD3Z5L4 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
5430403G16RikD3Z5L4 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
5430403G16RikD3Z5L4 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
5430403G16RikD3Z5L4 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms