Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

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Length 469 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc6D3YZP9 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc6D3YZP9 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc6D3YZP9 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc6D3YZP9 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc6D3YZP9 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc6D3YZP9 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc6D3YZP9 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc6D3YZP9 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc6D3YZP9 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc6D3YZP9 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc6D3YZP9 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc6D3YZP9 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc6D3YZP9 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc6D3YZP9 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc6D3YZP9 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc6D3YZP9 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc6D3YZP9 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc6D3YZP9 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc6D3YZP9 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc6D3YZP9 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc6D3YZP9 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc6D3YZP9 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc6D3YZP9 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc6D3YZP9 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc6D3YZP9 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc6D3YZP9 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc6D3YZP9 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc6D3YZP9 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc6D3YZP9 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc6D3YZP9 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc6D3YZP9 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc6D3YZP9 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc6D3YZP9 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc6D3YZP9 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc6D3YZP9 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc6D3YZP9 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc6D3YZP9 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc6D3YZP9 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc6D3YZP9 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc6D3YZP9 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc6D3YZP9 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc6D3YZP9 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc6D3YZP9 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc6D3YZP9 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc6D3YZP9 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc6D3YZP9 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc6D3YZP9 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc6D3YZP9 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc6D3YZP9 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc6D3YZP9 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc6D3YZP9 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc6D3YZP9 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc6D3YZP9 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc6D3YZP9 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc6D3YZP9 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc6D3YZP9 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc6D3YZP9 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc6D3YZP9 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc6D3YZP9 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc6D3YZP9 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc6D3YZP9 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc6D3YZP9 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc6D3YZP9 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc6D3YZP9 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc6D3YZP9 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc6D3YZP9 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc6D3YZP9 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc6D3YZP9 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc6D3YZP9 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc6D3YZP9 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc6D3YZP9 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc6D3YZP9 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc6D3YZP9 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc6D3YZP9 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc6D3YZP9 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc6D3YZP9 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc6D3YZP9 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc6D3YZP9 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc6D3YZP9 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc6D3YZP9 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc6D3YZP9 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc6D3YZP9 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc6D3YZP9 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc6D3YZP9 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc6D3YZP9 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc6D3YZP9 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc6D3YZP9 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc6D3YZP9 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc6D3YZP9 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc6D3YZP9 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc6D3YZP9 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc6D3YZP9 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc6D3YZP9 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc6D3YZP9 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc6D3YZP9 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc6D3YZP9 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc6D3YZP9 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc6D3YZP9 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc6D3YZP9 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
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