Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf217D3YYI7 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf217D3YYI7 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf217D3YYI7 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf217D3YYI7 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf217D3YYI7 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf217D3YYI7 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf217D3YYI7 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf217D3YYI7 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf217D3YYI7 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf217D3YYI7 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf217D3YYI7 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf217D3YYI7 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf217D3YYI7 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms