Protein–RNA interactions for Protein: B9EKI3

Tmf1, TATA element modulatory factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmf1B9EKI3 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmf1B9EKI3 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmf1B9EKI3 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmf1B9EKI3 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmf1B9EKI3 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmf1B9EKI3 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmf1B9EKI3 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmf1B9EKI3 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmf1B9EKI3 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmf1B9EKI3 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmf1B9EKI3 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmf1B9EKI3 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmf1B9EKI3 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmf1B9EKI3 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmf1B9EKI3 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmf1B9EKI3 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmf1B9EKI3 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmf1B9EKI3 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmf1B9EKI3 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmf1B9EKI3 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmf1B9EKI3 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmf1B9EKI3 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmf1B9EKI3 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmf1B9EKI3 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmf1B9EKI3 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmf1B9EKI3 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmf1B9EKI3 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmf1B9EKI3 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmf1B9EKI3 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmf1B9EKI3 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmf1B9EKI3 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmf1B9EKI3 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmf1B9EKI3 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmf1B9EKI3 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmf1B9EKI3 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmf1B9EKI3 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmf1B9EKI3 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmf1B9EKI3 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmf1B9EKI3 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmf1B9EKI3 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmf1B9EKI3 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmf1B9EKI3 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmf1B9EKI3 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmf1B9EKI3 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmf1B9EKI3 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmf1B9EKI3 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmf1B9EKI3 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmf1B9EKI3 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmf1B9EKI3 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmf1B9EKI3 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmf1B9EKI3 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmf1B9EKI3 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmf1B9EKI3 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmf1B9EKI3 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmf1B9EKI3 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmf1B9EKI3 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmf1B9EKI3 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmf1B9EKI3 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmf1B9EKI3 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmf1B9EKI3 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmf1B9EKI3 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmf1B9EKI3 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmf1B9EKI3 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmf1B9EKI3 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmf1B9EKI3 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmf1B9EKI3 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmf1B9EKI3 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tmf1B9EKI3 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tmf1B9EKI3 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tmf1B9EKI3 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tmf1B9EKI3 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tmf1B9EKI3 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tmf1B9EKI3 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmf1B9EKI3 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmf1B9EKI3 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmf1B9EKI3 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmf1B9EKI3 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmf1B9EKI3 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmf1B9EKI3 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmf1B9EKI3 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmf1B9EKI3 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmf1B9EKI3 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmf1B9EKI3 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmf1B9EKI3 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmf1B9EKI3 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmf1B9EKI3 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmf1B9EKI3 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmf1B9EKI3 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmf1B9EKI3 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmf1B9EKI3 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmf1B9EKI3 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmf1B9EKI3 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmf1B9EKI3 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmf1B9EKI3 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmf1B9EKI3 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmf1B9EKI3 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmf1B9EKI3 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmf1B9EKI3 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmf1B9EKI3 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmf1B9EKI3 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms