Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cttnbp2B9EJA2 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cttnbp2B9EJA2 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cttnbp2B9EJA2 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Cttnbp2B9EJA2 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Cttnbp2B9EJA2 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cttnbp2B9EJA2 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cttnbp2B9EJA2 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cttnbp2B9EJA2 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cttnbp2B9EJA2 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Cttnbp2B9EJA2 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Cttnbp2B9EJA2 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cttnbp2B9EJA2 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Cttnbp2B9EJA2 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Cttnbp2B9EJA2 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cttnbp2B9EJA2 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Cttnbp2B9EJA2 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cttnbp2B9EJA2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cttnbp2B9EJA2 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cttnbp2B9EJA2 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cttnbp2B9EJA2 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cttnbp2B9EJA2 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Cttnbp2B9EJA2 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cttnbp2B9EJA2 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Cttnbp2B9EJA2 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Cttnbp2B9EJA2 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Cttnbp2B9EJA2 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cttnbp2B9EJA2 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cttnbp2B9EJA2 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cttnbp2B9EJA2 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Cttnbp2B9EJA2 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cttnbp2B9EJA2 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Cttnbp2B9EJA2 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Cttnbp2B9EJA2 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cttnbp2B9EJA2 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cttnbp2B9EJA2 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Cttnbp2B9EJA2 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cttnbp2B9EJA2 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cttnbp2B9EJA2 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cttnbp2B9EJA2 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Cttnbp2B9EJA2 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cttnbp2B9EJA2 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Cttnbp2B9EJA2 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cttnbp2B9EJA2 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cttnbp2B9EJA2 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cttnbp2B9EJA2 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Cttnbp2B9EJA2 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cttnbp2B9EJA2 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cttnbp2B9EJA2 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cttnbp2B9EJA2 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Cttnbp2B9EJA2 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Cttnbp2B9EJA2 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cttnbp2B9EJA2 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cttnbp2B9EJA2 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cttnbp2B9EJA2 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cttnbp2B9EJA2 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cttnbp2B9EJA2 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cttnbp2B9EJA2 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cttnbp2B9EJA2 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cttnbp2B9EJA2 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Cttnbp2B9EJA2 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Cttnbp2B9EJA2 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Cttnbp2B9EJA2 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Cttnbp2B9EJA2 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cttnbp2B9EJA2 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cttnbp2B9EJA2 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cttnbp2B9EJA2 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cttnbp2B9EJA2 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cttnbp2B9EJA2 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cttnbp2B9EJA2 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cttnbp2B9EJA2 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cttnbp2B9EJA2 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cttnbp2B9EJA2 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cttnbp2B9EJA2 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cttnbp2B9EJA2 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Cttnbp2B9EJA2 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cttnbp2B9EJA2 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cttnbp2B9EJA2 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cttnbp2B9EJA2 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cttnbp2B9EJA2 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cttnbp2B9EJA2 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cttnbp2B9EJA2 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cttnbp2B9EJA2 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Cttnbp2B9EJA2 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cttnbp2B9EJA2 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cttnbp2B9EJA2 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cttnbp2B9EJA2 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cttnbp2B9EJA2 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cttnbp2B9EJA2 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cttnbp2B9EJA2 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cttnbp2B9EJA2 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cttnbp2B9EJA2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cttnbp2B9EJA2 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cttnbp2B9EJA2 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cttnbp2B9EJA2 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cttnbp2B9EJA2 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cttnbp2B9EJA2 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cttnbp2B9EJA2 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Cttnbp2B9EJA2 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cttnbp2B9EJA2 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms