Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Phf11cB4XVP9 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Phf11cB4XVP9 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms