Protein–RNA interactions for Protein: B2RXZ1

Pnldc1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnldc1B2RXZ1 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pnldc1B2RXZ1 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms