Protein–RNA interactions for Protein: B2RXA8

Gabrr3, Gamma-aminobutyric acid (GABA) receptor, rho 3, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrr3B2RXA8 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabrr3B2RXA8 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabrr3B2RXA8 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabrr3B2RXA8 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabrr3B2RXA8 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gabrr3B2RXA8 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabrr3B2RXA8 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabrr3B2RXA8 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabrr3B2RXA8 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabrr3B2RXA8 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabrr3B2RXA8 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabrr3B2RXA8 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabrr3B2RXA8 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabrr3B2RXA8 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabrr3B2RXA8 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabrr3B2RXA8 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabrr3B2RXA8 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabrr3B2RXA8 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabrr3B2RXA8 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabrr3B2RXA8 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabrr3B2RXA8 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabrr3B2RXA8 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gabrr3B2RXA8 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gabrr3B2RXA8 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gabrr3B2RXA8 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gabrr3B2RXA8 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gabrr3B2RXA8 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gabrr3B2RXA8 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabrr3B2RXA8 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabrr3B2RXA8 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabrr3B2RXA8 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabrr3B2RXA8 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabrr3B2RXA8 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabrr3B2RXA8 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabrr3B2RXA8 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabrr3B2RXA8 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabrr3B2RXA8 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabrr3B2RXA8 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabrr3B2RXA8 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabrr3B2RXA8 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabrr3B2RXA8 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabrr3B2RXA8 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabrr3B2RXA8 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabrr3B2RXA8 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabrr3B2RXA8 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabrr3B2RXA8 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabrr3B2RXA8 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabrr3B2RXA8 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabrr3B2RXA8 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabrr3B2RXA8 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabrr3B2RXA8 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabrr3B2RXA8 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabrr3B2RXA8 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabrr3B2RXA8 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabrr3B2RXA8 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabrr3B2RXA8 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabrr3B2RXA8 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabrr3B2RXA8 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabrr3B2RXA8 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabrr3B2RXA8 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabrr3B2RXA8 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabrr3B2RXA8 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabrr3B2RXA8 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabrr3B2RXA8 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabrr3B2RXA8 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabrr3B2RXA8 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabrr3B2RXA8 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabrr3B2RXA8 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabrr3B2RXA8 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabrr3B2RXA8 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabrr3B2RXA8 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabrr3B2RXA8 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabrr3B2RXA8 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabrr3B2RXA8 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabrr3B2RXA8 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabrr3B2RXA8 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabrr3B2RXA8 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabrr3B2RXA8 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabrr3B2RXA8 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabrr3B2RXA8 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabrr3B2RXA8 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabrr3B2RXA8 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabrr3B2RXA8 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabrr3B2RXA8 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabrr3B2RXA8 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabrr3B2RXA8 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabrr3B2RXA8 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabrr3B2RXA8 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabrr3B2RXA8 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabrr3B2RXA8 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabrr3B2RXA8 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabrr3B2RXA8 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabrr3B2RXA8 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabrr3B2RXA8 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabrr3B2RXA8 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabrr3B2RXA8 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabrr3B2RXA8 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabrr3B2RXA8 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabrr3B2RXA8 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabrr3B2RXA8 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms