Protein–RNA interactions for Protein: B2RT41

Zfc3h1, Zinc finger, C3H1-type-containing, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,992 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfc3h1B2RT41 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfc3h1B2RT41 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfc3h1B2RT41 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfc3h1B2RT41 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfc3h1B2RT41 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfc3h1B2RT41 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfc3h1B2RT41 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfc3h1B2RT41 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfc3h1B2RT41 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfc3h1B2RT41 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfc3h1B2RT41 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfc3h1B2RT41 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfc3h1B2RT41 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfc3h1B2RT41 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfc3h1B2RT41 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfc3h1B2RT41 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfc3h1B2RT41 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfc3h1B2RT41 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfc3h1B2RT41 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfc3h1B2RT41 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfc3h1B2RT41 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfc3h1B2RT41 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfc3h1B2RT41 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfc3h1B2RT41 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfc3h1B2RT41 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfc3h1B2RT41 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfc3h1B2RT41 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfc3h1B2RT41 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfc3h1B2RT41 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfc3h1B2RT41 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfc3h1B2RT41 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfc3h1B2RT41 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfc3h1B2RT41 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfc3h1B2RT41 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfc3h1B2RT41 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfc3h1B2RT41 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfc3h1B2RT41 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfc3h1B2RT41 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfc3h1B2RT41 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfc3h1B2RT41 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfc3h1B2RT41 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfc3h1B2RT41 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfc3h1B2RT41 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfc3h1B2RT41 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfc3h1B2RT41 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfc3h1B2RT41 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfc3h1B2RT41 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfc3h1B2RT41 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfc3h1B2RT41 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfc3h1B2RT41 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfc3h1B2RT41 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfc3h1B2RT41 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfc3h1B2RT41 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfc3h1B2RT41 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfc3h1B2RT41 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfc3h1B2RT41 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfc3h1B2RT41 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfc3h1B2RT41 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfc3h1B2RT41 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfc3h1B2RT41 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfc3h1B2RT41 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfc3h1B2RT41 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfc3h1B2RT41 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfc3h1B2RT41 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfc3h1B2RT41 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfc3h1B2RT41 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfc3h1B2RT41 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfc3h1B2RT41 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfc3h1B2RT41 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfc3h1B2RT41 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfc3h1B2RT41 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfc3h1B2RT41 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfc3h1B2RT41 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfc3h1B2RT41 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfc3h1B2RT41 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfc3h1B2RT41 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfc3h1B2RT41 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfc3h1B2RT41 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfc3h1B2RT41 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfc3h1B2RT41 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfc3h1B2RT41 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfc3h1B2RT41 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfc3h1B2RT41 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfc3h1B2RT41 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfc3h1B2RT41 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfc3h1B2RT41 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfc3h1B2RT41 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfc3h1B2RT41 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfc3h1B2RT41 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfc3h1B2RT41 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfc3h1B2RT41 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfc3h1B2RT41 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfc3h1B2RT41 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfc3h1B2RT41 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfc3h1B2RT41 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfc3h1B2RT41 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfc3h1B2RT41 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfc3h1B2RT41 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfc3h1B2RT41 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfc3h1B2RT41 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms