Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rrn3B2RS91 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rrn3B2RS91 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rrn3B2RS91 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rrn3B2RS91 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rrn3B2RS91 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rrn3B2RS91 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rrn3B2RS91 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rrn3B2RS91 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rrn3B2RS91 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rrn3B2RS91 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rrn3B2RS91 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rrn3B2RS91 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rrn3B2RS91 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rrn3B2RS91 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rrn3B2RS91 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rrn3B2RS91 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rrn3B2RS91 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rrn3B2RS91 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rrn3B2RS91 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rrn3B2RS91 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rrn3B2RS91 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rrn3B2RS91 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rrn3B2RS91 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rrn3B2RS91 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rrn3B2RS91 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rrn3B2RS91 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rrn3B2RS91 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rrn3B2RS91 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rrn3B2RS91 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rrn3B2RS91 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rrn3B2RS91 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rrn3B2RS91 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rrn3B2RS91 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rrn3B2RS91 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rrn3B2RS91 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rrn3B2RS91 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rrn3B2RS91 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rrn3B2RS91 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rrn3B2RS91 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rrn3B2RS91 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rrn3B2RS91 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rrn3B2RS91 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rrn3B2RS91 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rrn3B2RS91 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rrn3B2RS91 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rrn3B2RS91 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rrn3B2RS91 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rrn3B2RS91 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rrn3B2RS91 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rrn3B2RS91 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rrn3B2RS91 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rrn3B2RS91 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rrn3B2RS91 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rrn3B2RS91 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rrn3B2RS91 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rrn3B2RS91 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rrn3B2RS91 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rrn3B2RS91 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rrn3B2RS91 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rrn3B2RS91 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rrn3B2RS91 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rrn3B2RS91 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rrn3B2RS91 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rrn3B2RS91 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rrn3B2RS91 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rrn3B2RS91 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rrn3B2RS91 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rrn3B2RS91 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rrn3B2RS91 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rrn3B2RS91 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rrn3B2RS91 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rrn3B2RS91 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rrn3B2RS91 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rrn3B2RS91 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rrn3B2RS91 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rrn3B2RS91 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rrn3B2RS91 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rrn3B2RS91 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rrn3B2RS91 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rrn3B2RS91 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rrn3B2RS91 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrn3B2RS91 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrn3B2RS91 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrn3B2RS91 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrn3B2RS91 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrn3B2RS91 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrn3B2RS91 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrn3B2RS91 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrn3B2RS91 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrn3B2RS91 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrn3B2RS91 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrn3B2RS91 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrn3B2RS91 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrn3B2RS91 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrn3B2RS91 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrn3B2RS91 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrn3B2RS91 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrn3B2RS91 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rrn3B2RS91 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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