Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE4

Znf518b, Zinc finger protein 518B, mousemouse

Predictions only

Length 1,077 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf518bB2RRE4 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf518bB2RRE4 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf518bB2RRE4 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf518bB2RRE4 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf518bB2RRE4 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf518bB2RRE4 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf518bB2RRE4 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf518bB2RRE4 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf518bB2RRE4 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf518bB2RRE4 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf518bB2RRE4 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf518bB2RRE4 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf518bB2RRE4 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf518bB2RRE4 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf518bB2RRE4 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf518bB2RRE4 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf518bB2RRE4 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf518bB2RRE4 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf518bB2RRE4 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf518bB2RRE4 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf518bB2RRE4 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf518bB2RRE4 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf518bB2RRE4 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf518bB2RRE4 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf518bB2RRE4 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf518bB2RRE4 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf518bB2RRE4 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf518bB2RRE4 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf518bB2RRE4 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf518bB2RRE4 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf518bB2RRE4 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf518bB2RRE4 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf518bB2RRE4 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf518bB2RRE4 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf518bB2RRE4 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf518bB2RRE4 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf518bB2RRE4 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf518bB2RRE4 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf518bB2RRE4 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf518bB2RRE4 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf518bB2RRE4 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf518bB2RRE4 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf518bB2RRE4 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf518bB2RRE4 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf518bB2RRE4 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf518bB2RRE4 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf518bB2RRE4 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf518bB2RRE4 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf518bB2RRE4 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf518bB2RRE4 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf518bB2RRE4 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf518bB2RRE4 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf518bB2RRE4 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf518bB2RRE4 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf518bB2RRE4 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf518bB2RRE4 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf518bB2RRE4 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf518bB2RRE4 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf518bB2RRE4 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf518bB2RRE4 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf518bB2RRE4 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf518bB2RRE4 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf518bB2RRE4 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf518bB2RRE4 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf518bB2RRE4 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf518bB2RRE4 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf518bB2RRE4 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Znf518bB2RRE4 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Znf518bB2RRE4 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Znf518bB2RRE4 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Znf518bB2RRE4 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Znf518bB2RRE4 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Znf518bB2RRE4 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Znf518bB2RRE4 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Znf518bB2RRE4 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Znf518bB2RRE4 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Znf518bB2RRE4 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Znf518bB2RRE4 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Znf518bB2RRE4 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Znf518bB2RRE4 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Znf518bB2RRE4 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Znf518bB2RRE4 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Znf518bB2RRE4 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Znf518bB2RRE4 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Znf518bB2RRE4 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Znf518bB2RRE4 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Znf518bB2RRE4 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Znf518bB2RRE4 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Znf518bB2RRE4 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Znf518bB2RRE4 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Znf518bB2RRE4 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Znf518bB2RRE4 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Znf518bB2RRE4 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Znf518bB2RRE4 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Znf518bB2RRE4 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Znf518bB2RRE4 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Znf518bB2RRE4 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Znf518bB2RRE4 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Znf518bB2RRE4 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Znf518bB2RRE4 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms