Protein–RNA interactions for Protein: B2RQG2

Phf3, PHD finger protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf3B2RQG2 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Phf3B2RQG2 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phf3B2RQG2 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phf3B2RQG2 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phf3B2RQG2 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phf3B2RQG2 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Phf3B2RQG2 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phf3B2RQG2 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phf3B2RQG2 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phf3B2RQG2 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phf3B2RQG2 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Phf3B2RQG2 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Phf3B2RQG2 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Phf3B2RQG2 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phf3B2RQG2 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Phf3B2RQG2 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phf3B2RQG2 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phf3B2RQG2 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Phf3B2RQG2 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phf3B2RQG2 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phf3B2RQG2 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms