Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Uhrf1bp1B2KF50 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Uhrf1bp1B2KF50 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Uhrf1bp1B2KF50 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Uhrf1bp1B2KF50 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Uhrf1bp1B2KF50 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Uhrf1bp1B2KF50 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Uhrf1bp1B2KF50 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Uhrf1bp1B2KF50 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Uhrf1bp1B2KF50 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Uhrf1bp1B2KF50 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Uhrf1bp1B2KF50 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Uhrf1bp1B2KF50 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Uhrf1bp1B2KF50 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Uhrf1bp1B2KF50 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Uhrf1bp1B2KF50 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Uhrf1bp1B2KF50 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Uhrf1bp1B2KF50 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Uhrf1bp1B2KF50 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Uhrf1bp1B2KF50 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Uhrf1bp1B2KF50 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Uhrf1bp1B2KF50 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Uhrf1bp1B2KF50 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Uhrf1bp1B2KF50 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Uhrf1bp1B2KF50 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Uhrf1bp1B2KF50 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Uhrf1bp1B2KF50 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Uhrf1bp1B2KF50 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Uhrf1bp1B2KF50 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Uhrf1bp1B2KF50 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Uhrf1bp1B2KF50 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Uhrf1bp1B2KF50 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Uhrf1bp1B2KF50 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Uhrf1bp1B2KF50 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Uhrf1bp1B2KF50 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Uhrf1bp1B2KF50 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Uhrf1bp1B2KF50 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Uhrf1bp1B2KF50 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Uhrf1bp1B2KF50 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Uhrf1bp1B2KF50 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Uhrf1bp1B2KF50 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Uhrf1bp1B2KF50 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Uhrf1bp1B2KF50 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Uhrf1bp1B2KF50 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Uhrf1bp1B2KF50 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Uhrf1bp1B2KF50 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Uhrf1bp1B2KF50 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Uhrf1bp1B2KF50 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Uhrf1bp1B2KF50 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Uhrf1bp1B2KF50 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Uhrf1bp1B2KF50 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Uhrf1bp1B2KF50 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Uhrf1bp1B2KF50 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Uhrf1bp1B2KF50 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Uhrf1bp1B2KF50 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Uhrf1bp1B2KF50 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Uhrf1bp1B2KF50 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Uhrf1bp1B2KF50 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Uhrf1bp1B2KF50 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Uhrf1bp1B2KF50 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Uhrf1bp1B2KF50 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Uhrf1bp1B2KF50 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Uhrf1bp1B2KF50 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Uhrf1bp1B2KF50 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Uhrf1bp1B2KF50 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Uhrf1bp1B2KF50 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Uhrf1bp1B2KF50 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Uhrf1bp1B2KF50 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Uhrf1bp1B2KF50 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
Uhrf1bp1B2KF50 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Uhrf1bp1B2KF50 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Uhrf1bp1B2KF50 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Uhrf1bp1B2KF50 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Uhrf1bp1B2KF50 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Uhrf1bp1B2KF50 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Uhrf1bp1B2KF50 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Uhrf1bp1B2KF50 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Uhrf1bp1B2KF50 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Uhrf1bp1B2KF50 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Uhrf1bp1B2KF50 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Uhrf1bp1B2KF50 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Uhrf1bp1B2KF50 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Uhrf1bp1B2KF50 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Uhrf1bp1B2KF50 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Uhrf1bp1B2KF50 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Uhrf1bp1B2KF50 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Uhrf1bp1B2KF50 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Uhrf1bp1B2KF50 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Uhrf1bp1B2KF50 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Uhrf1bp1B2KF50 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Uhrf1bp1B2KF50 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Uhrf1bp1B2KF50 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Uhrf1bp1B2KF50 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Uhrf1bp1B2KF50 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Uhrf1bp1B2KF50 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Uhrf1bp1B2KF50 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Uhrf1bp1B2KF50 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Uhrf1bp1B2KF50 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms