Protein–RNA interactions for Protein: B1B213

H60c, Histocompatibility antigen 60c, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H60cB1B213 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H60cB1B213 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H60cB1B213 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H60cB1B213 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H60cB1B213 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H60cB1B213 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H60cB1B213 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H60cB1B213 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H60cB1B213 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H60cB1B213 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H60cB1B213 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H60cB1B213 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
H60cB1B213 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
H60cB1B213 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H60cB1B213 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H60cB1B213 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
H60cB1B213 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H60cB1B213 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
H60cB1B213 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H60cB1B213 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
H60cB1B213 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H60cB1B213 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H60cB1B213 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H60cB1B213 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H60cB1B213 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H60cB1B213 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H60cB1B213 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H60cB1B213 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms