Protein–RNA interactions for Protein: B1AV60

Nhs, NHS actin-remodeling regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NhsB1AV60 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NhsB1AV60 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NhsB1AV60 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NhsB1AV60 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NhsB1AV60 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NhsB1AV60 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NhsB1AV60 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NhsB1AV60 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NhsB1AV60 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NhsB1AV60 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NhsB1AV60 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NhsB1AV60 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NhsB1AV60 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NhsB1AV60 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NhsB1AV60 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NhsB1AV60 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NhsB1AV60 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NhsB1AV60 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NhsB1AV60 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NhsB1AV60 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NhsB1AV60 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NhsB1AV60 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NhsB1AV60 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NhsB1AV60 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NhsB1AV60 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NhsB1AV60 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NhsB1AV60 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NhsB1AV60 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NhsB1AV60 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NhsB1AV60 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NhsB1AV60 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NhsB1AV60 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NhsB1AV60 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NhsB1AV60 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NhsB1AV60 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NhsB1AV60 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NhsB1AV60 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NhsB1AV60 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NhsB1AV60 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NhsB1AV60 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NhsB1AV60 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NhsB1AV60 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NhsB1AV60 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NhsB1AV60 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NhsB1AV60 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NhsB1AV60 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NhsB1AV60 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NhsB1AV60 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NhsB1AV60 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NhsB1AV60 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NhsB1AV60 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NhsB1AV60 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NhsB1AV60 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NhsB1AV60 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NhsB1AV60 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NhsB1AV60 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NhsB1AV60 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NhsB1AV60 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NhsB1AV60 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NhsB1AV60 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NhsB1AV60 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NhsB1AV60 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NhsB1AV60 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NhsB1AV60 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NhsB1AV60 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NhsB1AV60 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NhsB1AV60 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NhsB1AV60 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NhsB1AV60 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NhsB1AV60 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NhsB1AV60 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NhsB1AV60 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NhsB1AV60 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NhsB1AV60 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NhsB1AV60 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NhsB1AV60 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NhsB1AV60 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NhsB1AV60 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NhsB1AV60 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NhsB1AV60 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NhsB1AV60 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NhsB1AV60 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NhsB1AV60 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NhsB1AV60 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NhsB1AV60 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NhsB1AV60 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NhsB1AV60 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NhsB1AV60 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NhsB1AV60 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NhsB1AV60 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NhsB1AV60 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NhsB1AV60 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NhsB1AV60 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NhsB1AV60 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NhsB1AV60 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NhsB1AV60 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NhsB1AV60 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NhsB1AV60 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NhsB1AV60 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NhsB1AV60 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms