Protein–RNA interactions for Protein: B1AUS7

Ssxa1, Protein SSXA1, mousemouse

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Length 101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxa1B1AUS7 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssxa1B1AUS7 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssxa1B1AUS7 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssxa1B1AUS7 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssxa1B1AUS7 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssxa1B1AUS7 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssxa1B1AUS7 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssxa1B1AUS7 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssxa1B1AUS7 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssxa1B1AUS7 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssxa1B1AUS7 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssxa1B1AUS7 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssxa1B1AUS7 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssxa1B1AUS7 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssxa1B1AUS7 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssxa1B1AUS7 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssxa1B1AUS7 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssxa1B1AUS7 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssxa1B1AUS7 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssxa1B1AUS7 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssxa1B1AUS7 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssxa1B1AUS7 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssxa1B1AUS7 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssxa1B1AUS7 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssxa1B1AUS7 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssxa1B1AUS7 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssxa1B1AUS7 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssxa1B1AUS7 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssxa1B1AUS7 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssxa1B1AUS7 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssxa1B1AUS7 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssxa1B1AUS7 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssxa1B1AUS7 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssxa1B1AUS7 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssxa1B1AUS7 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssxa1B1AUS7 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssxa1B1AUS7 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssxa1B1AUS7 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssxa1B1AUS7 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssxa1B1AUS7 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssxa1B1AUS7 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssxa1B1AUS7 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssxa1B1AUS7 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssxa1B1AUS7 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssxa1B1AUS7 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssxa1B1AUS7 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssxa1B1AUS7 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssxa1B1AUS7 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssxa1B1AUS7 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssxa1B1AUS7 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssxa1B1AUS7 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssxa1B1AUS7 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssxa1B1AUS7 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssxa1B1AUS7 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssxa1B1AUS7 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssxa1B1AUS7 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssxa1B1AUS7 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssxa1B1AUS7 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssxa1B1AUS7 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssxa1B1AUS7 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssxa1B1AUS7 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssxa1B1AUS7 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssxa1B1AUS7 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssxa1B1AUS7 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssxa1B1AUS7 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssxa1B1AUS7 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssxa1B1AUS7 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssxa1B1AUS7 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssxa1B1AUS7 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssxa1B1AUS7 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssxa1B1AUS7 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssxa1B1AUS7 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssxa1B1AUS7 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssxa1B1AUS7 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssxa1B1AUS7 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssxa1B1AUS7 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssxa1B1AUS7 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssxa1B1AUS7 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssxa1B1AUS7 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssxa1B1AUS7 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssxa1B1AUS7 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssxa1B1AUS7 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssxa1B1AUS7 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssxa1B1AUS7 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssxa1B1AUS7 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssxa1B1AUS7 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssxa1B1AUS7 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssxa1B1AUS7 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssxa1B1AUS7 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssxa1B1AUS7 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssxa1B1AUS7 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssxa1B1AUS7 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssxa1B1AUS7 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssxa1B1AUS7 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssxa1B1AUS7 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssxa1B1AUS7 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssxa1B1AUS7 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssxa1B1AUS7 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssxa1B1AUS7 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssxa1B1AUS7 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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