Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Grik3B1AS29 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Grik3B1AS29 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Grik3B1AS29 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Grik3B1AS29 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Grik3B1AS29 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Grik3B1AS29 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Grik3B1AS29 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Grik3B1AS29 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Grik3B1AS29 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Grik3B1AS29 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Grik3B1AS29 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Grik3B1AS29 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Grik3B1AS29 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Grik3B1AS29 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Grik3B1AS29 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Grik3B1AS29 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Grik3B1AS29 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Grik3B1AS29 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Grik3B1AS29 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Grik3B1AS29 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Grik3B1AS29 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Grik3B1AS29 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Grik3B1AS29 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Grik3B1AS29 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Grik3B1AS29 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Grik3B1AS29 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Grik3B1AS29 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Grik3B1AS29 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Grik3B1AS29 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Grik3B1AS29 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Grik3B1AS29 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Grik3B1AS29 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Grik3B1AS29 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Grik3B1AS29 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Grik3B1AS29 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Grik3B1AS29 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Grik3B1AS29 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Grik3B1AS29 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Grik3B1AS29 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Grik3B1AS29 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Grik3B1AS29 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Grik3B1AS29 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Grik3B1AS29 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Grik3B1AS29 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Grik3B1AS29 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Grik3B1AS29 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Grik3B1AS29 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Grik3B1AS29 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Grik3B1AS29 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Grik3B1AS29 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Grik3B1AS29 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Grik3B1AS29 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Grik3B1AS29 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Grik3B1AS29 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Grik3B1AS29 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Grik3B1AS29 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Grik3B1AS29 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Grik3B1AS29 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Grik3B1AS29 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Grik3B1AS29 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Grik3B1AS29 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Grik3B1AS29 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Grik3B1AS29 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Grik3B1AS29 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Grik3B1AS29 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Grik3B1AS29 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Grik3B1AS29 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Grik3B1AS29 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Grik3B1AS29 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Grik3B1AS29 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Grik3B1AS29 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Grik3B1AS29 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Grik3B1AS29 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Grik3B1AS29 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Grik3B1AS29 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Grik3B1AS29 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Grik3B1AS29 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Grik3B1AS29 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Grik3B1AS29 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Grik3B1AS29 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Grik3B1AS29 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Grik3B1AS29 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Grik3B1AS29 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Grik3B1AS29 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Grik3B1AS29 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Grik3B1AS29 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Grik3B1AS29 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Grik3B1AS29 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Grik3B1AS29 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Grik3B1AS29 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Grik3B1AS29 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Grik3B1AS29 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Grik3B1AS29 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Grik3B1AS29 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Grik3B1AS29 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Grik3B1AS29 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Grik3B1AS29 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Grik3B1AS29 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Grik3B1AS29 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms