Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
H2-M5A7VMS3 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-M5A7VMS3 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-M5A7VMS3 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-M5A7VMS3 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-M5A7VMS3 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-M5A7VMS3 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-M5A7VMS3 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-M5A7VMS3 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-M5A7VMS3 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-M5A7VMS3 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-M5A7VMS3 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-M5A7VMS3 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-M5A7VMS3 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-M5A7VMS3 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-M5A7VMS3 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-M5A7VMS3 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-M5A7VMS3 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-M5A7VMS3 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-M5A7VMS3 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-M5A7VMS3 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-M5A7VMS3 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-M5A7VMS3 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-M5A7VMS3 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-M5A7VMS3 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-M5A7VMS3 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-M5A7VMS3 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-M5A7VMS3 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-M5A7VMS3 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-M5A7VMS3 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-M5A7VMS3 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-M5A7VMS3 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-M5A7VMS3 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H2-M5A7VMS3 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H2-M5A7VMS3 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H2-M5A7VMS3 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H2-M5A7VMS3 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H2-M5A7VMS3 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
H2-M5A7VMS3 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H2-M5A7VMS3 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H2-M5A7VMS3 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H2-M5A7VMS3 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
H2-M5A7VMS3 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H2-M5A7VMS3 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H2-M5A7VMS3 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H2-M5A7VMS3 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
H2-M5A7VMS3 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H2-M5A7VMS3 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
H2-M5A7VMS3 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H2-M5A7VMS3 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H2-M5A7VMS3 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H2-M5A7VMS3 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
H2-M5A7VMS3 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H2-M5A7VMS3 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
H2-M5A7VMS3 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
H2-M5A7VMS3 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H2-M5A7VMS3 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H2-M5A7VMS3 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H2-M5A7VMS3 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
H2-M5A7VMS3 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
H2-M5A7VMS3 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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