Protein–RNA interactions for Protein: A2J008

Trgv2, MCG146472 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trgv2A2J008 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Trgv2A2J008 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trgv2A2J008 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trgv2A2J008 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trgv2A2J008 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trgv2A2J008 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trgv2A2J008 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trgv2A2J008 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trgv2A2J008 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trgv2A2J008 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trgv2A2J008 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trgv2A2J008 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trgv2A2J008 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trgv2A2J008 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trgv2A2J008 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trgv2A2J008 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trgv2A2J008 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trgv2A2J008 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trgv2A2J008 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trgv2A2J008 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trgv2A2J008 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trgv2A2J008 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trgv2A2J008 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trgv2A2J008 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trgv2A2J008 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trgv2A2J008 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trgv2A2J008 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trgv2A2J008 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trgv2A2J008 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trgv2A2J008 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trgv2A2J008 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trgv2A2J008 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trgv2A2J008 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trgv2A2J008 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Trgv2A2J008 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trgv2A2J008 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trgv2A2J008 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trgv2A2J008 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trgv2A2J008 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trgv2A2J008 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trgv2A2J008 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trgv2A2J008 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trgv2A2J008 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trgv2A2J008 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trgv2A2J008 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trgv2A2J008 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trgv2A2J008 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trgv2A2J008 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trgv2A2J008 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trgv2A2J008 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trgv2A2J008 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trgv2A2J008 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trgv2A2J008 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trgv2A2J008 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trgv2A2J008 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trgv2A2J008 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trgv2A2J008 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trgv2A2J008 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trgv2A2J008 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trgv2A2J008 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trgv2A2J008 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trgv2A2J008 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Trgv2A2J008 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trgv2A2J008 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trgv2A2J008 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trgv2A2J008 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trgv2A2J008 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trgv2A2J008 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trgv2A2J008 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trgv2A2J008 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trgv2A2J008 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trgv2A2J008 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trgv2A2J008 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trgv2A2J008 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trgv2A2J008 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trgv2A2J008 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trgv2A2J008 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trgv2A2J008 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trgv2A2J008 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trgv2A2J008 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trgv2A2J008 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trgv2A2J008 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trgv2A2J008 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trgv2A2J008 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trgv2A2J008 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trgv2A2J008 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trgv2A2J008 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trgv2A2J008 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trgv2A2J008 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trgv2A2J008 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trgv2A2J008 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trgv2A2J008 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trgv2A2J008 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trgv2A2J008 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trgv2A2J008 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trgv2A2J008 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trgv2A2J008 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trgv2A2J008 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trgv2A2J008 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trgv2A2J008 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms