Protein–RNA interactions for Protein: A2ASQ1

Agrn, Agrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,950 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AgrnA2ASQ1 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AgrnA2ASQ1 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AgrnA2ASQ1 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AgrnA2ASQ1 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AgrnA2ASQ1 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AgrnA2ASQ1 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AgrnA2ASQ1 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AgrnA2ASQ1 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AgrnA2ASQ1 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
AgrnA2ASQ1 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AgrnA2ASQ1 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AgrnA2ASQ1 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AgrnA2ASQ1 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AgrnA2ASQ1 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AgrnA2ASQ1 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AgrnA2ASQ1 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
AgrnA2ASQ1 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AgrnA2ASQ1 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AgrnA2ASQ1 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AgrnA2ASQ1 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AgrnA2ASQ1 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AgrnA2ASQ1 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AgrnA2ASQ1 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AgrnA2ASQ1 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AgrnA2ASQ1 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AgrnA2ASQ1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AgrnA2ASQ1 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AgrnA2ASQ1 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
AgrnA2ASQ1 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AgrnA2ASQ1 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AgrnA2ASQ1 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AgrnA2ASQ1 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AgrnA2ASQ1 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AgrnA2ASQ1 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AgrnA2ASQ1 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AgrnA2ASQ1 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AgrnA2ASQ1 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AgrnA2ASQ1 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
AgrnA2ASQ1 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AgrnA2ASQ1 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
AgrnA2ASQ1 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AgrnA2ASQ1 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AgrnA2ASQ1 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AgrnA2ASQ1 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AgrnA2ASQ1 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AgrnA2ASQ1 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
AgrnA2ASQ1 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
AgrnA2ASQ1 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
AgrnA2ASQ1 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
AgrnA2ASQ1 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AgrnA2ASQ1 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AgrnA2ASQ1 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AgrnA2ASQ1 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AgrnA2ASQ1 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
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AgrnA2ASQ1 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AgrnA2ASQ1 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
AgrnA2ASQ1 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
AgrnA2ASQ1 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AgrnA2ASQ1 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AgrnA2ASQ1 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AgrnA2ASQ1 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.07■□□□□ 0
AgrnA2ASQ1 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AgrnA2ASQ1 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AgrnA2ASQ1 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AgrnA2ASQ1 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AgrnA2ASQ1 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AgrnA2ASQ1 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AgrnA2ASQ1 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AgrnA2ASQ1 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
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AgrnA2ASQ1 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AgrnA2ASQ1 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
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AgrnA2ASQ1 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AgrnA2ASQ1 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AgrnA2ASQ1 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AgrnA2ASQ1 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AgrnA2ASQ1 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
AgrnA2ASQ1 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
AgrnA2ASQ1 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AgrnA2ASQ1 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AgrnA2ASQ1 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AgrnA2ASQ1 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AgrnA2ASQ1 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AgrnA2ASQ1 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AgrnA2ASQ1 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AgrnA2ASQ1 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
AgrnA2ASQ1 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
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AgrnA2ASQ1 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AgrnA2ASQ1 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
AgrnA2ASQ1 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
AgrnA2ASQ1 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
AgrnA2ASQ1 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AgrnA2ASQ1 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AgrnA2ASQ1 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AgrnA2ASQ1 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AgrnA2ASQ1 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AgrnA2ASQ1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms