Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ07

Tubb1, Tubulin beta-1 chain, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb1A2AQ07 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tubb1A2AQ07 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tubb1A2AQ07 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tubb1A2AQ07 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tubb1A2AQ07 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tubb1A2AQ07 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tubb1A2AQ07 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tubb1A2AQ07 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tubb1A2AQ07 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tubb1A2AQ07 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tubb1A2AQ07 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tubb1A2AQ07 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tubb1A2AQ07 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tubb1A2AQ07 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tubb1A2AQ07 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tubb1A2AQ07 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tubb1A2AQ07 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tubb1A2AQ07 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tubb1A2AQ07 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tubb1A2AQ07 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tubb1A2AQ07 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tubb1A2AQ07 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tubb1A2AQ07 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tubb1A2AQ07 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tubb1A2AQ07 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tubb1A2AQ07 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tubb1A2AQ07 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tubb1A2AQ07 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tubb1A2AQ07 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tubb1A2AQ07 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tubb1A2AQ07 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tubb1A2AQ07 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tubb1A2AQ07 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tubb1A2AQ07 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tubb1A2AQ07 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tubb1A2AQ07 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tubb1A2AQ07 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tubb1A2AQ07 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tubb1A2AQ07 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tubb1A2AQ07 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tubb1A2AQ07 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tubb1A2AQ07 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tubb1A2AQ07 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tubb1A2AQ07 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tubb1A2AQ07 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tubb1A2AQ07 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tubb1A2AQ07 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tubb1A2AQ07 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tubb1A2AQ07 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tubb1A2AQ07 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tubb1A2AQ07 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tubb1A2AQ07 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tubb1A2AQ07 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tubb1A2AQ07 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tubb1A2AQ07 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms