Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CtcflA2APF3 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CtcflA2APF3 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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