Protein–RNA interactions for Protein: A2AJK6

Chd7, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,986 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd7A2AJK6 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Chd7A2AJK6 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chd7A2AJK6 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Chd7A2AJK6 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chd7A2AJK6 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Chd7A2AJK6 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chd7A2AJK6 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chd7A2AJK6 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chd7A2AJK6 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chd7A2AJK6 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chd7A2AJK6 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chd7A2AJK6 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chd7A2AJK6 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chd7A2AJK6 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chd7A2AJK6 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chd7A2AJK6 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Chd7A2AJK6 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chd7A2AJK6 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chd7A2AJK6 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chd7A2AJK6 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chd7A2AJK6 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chd7A2AJK6 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chd7A2AJK6 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chd7A2AJK6 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chd7A2AJK6 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chd7A2AJK6 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chd7A2AJK6 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chd7A2AJK6 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chd7A2AJK6 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chd7A2AJK6 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chd7A2AJK6 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chd7A2AJK6 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chd7A2AJK6 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chd7A2AJK6 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chd7A2AJK6 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chd7A2AJK6 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chd7A2AJK6 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chd7A2AJK6 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chd7A2AJK6 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chd7A2AJK6 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chd7A2AJK6 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chd7A2AJK6 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chd7A2AJK6 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chd7A2AJK6 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chd7A2AJK6 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chd7A2AJK6 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chd7A2AJK6 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chd7A2AJK6 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Chd7A2AJK6 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chd7A2AJK6 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chd7A2AJK6 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chd7A2AJK6 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chd7A2AJK6 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chd7A2AJK6 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd7A2AJK6 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd7A2AJK6 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd7A2AJK6 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd7A2AJK6 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd7A2AJK6 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd7A2AJK6 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd7A2AJK6 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd7A2AJK6 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd7A2AJK6 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd7A2AJK6 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd7A2AJK6 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd7A2AJK6 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd7A2AJK6 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd7A2AJK6 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd7A2AJK6 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd7A2AJK6 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd7A2AJK6 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd7A2AJK6 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd7A2AJK6 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd7A2AJK6 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd7A2AJK6 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd7A2AJK6 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd7A2AJK6 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd7A2AJK6 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd7A2AJK6 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd7A2AJK6 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd7A2AJK6 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd7A2AJK6 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd7A2AJK6 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd7A2AJK6 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd7A2AJK6 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd7A2AJK6 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd7A2AJK6 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd7A2AJK6 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd7A2AJK6 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd7A2AJK6 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd7A2AJK6 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd7A2AJK6 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd7A2AJK6 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd7A2AJK6 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd7A2AJK6 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd7A2AJK6 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd7A2AJK6 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd7A2AJK6 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd7A2AJK6 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd7A2AJK6 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms