Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lcn6A2AJB9 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lcn6A2AJB9 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lcn6A2AJB9 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lcn6A2AJB9 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lcn6A2AJB9 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lcn6A2AJB9 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lcn6A2AJB9 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Lcn6A2AJB9 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lcn6A2AJB9 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lcn6A2AJB9 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lcn6A2AJB9 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lcn6A2AJB9 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lcn6A2AJB9 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Lcn6A2AJB9 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Lcn6A2AJB9 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Lcn6A2AJB9 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lcn6A2AJB9 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lcn6A2AJB9 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Lcn6A2AJB9 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lcn6A2AJB9 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Lcn6A2AJB9 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Lcn6A2AJB9 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Lcn6A2AJB9 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lcn6A2AJB9 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lcn6A2AJB9 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Lcn6A2AJB9 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lcn6A2AJB9 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lcn6A2AJB9 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Lcn6A2AJB9 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lcn6A2AJB9 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lcn6A2AJB9 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lcn6A2AJB9 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lcn6A2AJB9 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lcn6A2AJB9 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lcn6A2AJB9 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lcn6A2AJB9 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lcn6A2AJB9 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lcn6A2AJB9 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lcn6A2AJB9 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lcn6A2AJB9 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lcn6A2AJB9 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lcn6A2AJB9 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lcn6A2AJB9 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lcn6A2AJB9 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lcn6A2AJB9 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lcn6A2AJB9 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lcn6A2AJB9 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lcn6A2AJB9 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lcn6A2AJB9 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lcn6A2AJB9 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Lcn6A2AJB9 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lcn6A2AJB9 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Lcn6A2AJB9 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lcn6A2AJB9 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lcn6A2AJB9 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lcn6A2AJB9 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lcn6A2AJB9 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lcn6A2AJB9 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lcn6A2AJB9 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lcn6A2AJB9 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lcn6A2AJB9 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lcn6A2AJB9 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lcn6A2AJB9 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lcn6A2AJB9 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lcn6A2AJB9 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lcn6A2AJB9 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lcn6A2AJB9 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lcn6A2AJB9 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lcn6A2AJB9 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lcn6A2AJB9 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lcn6A2AJB9 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lcn6A2AJB9 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lcn6A2AJB9 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lcn6A2AJB9 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lcn6A2AJB9 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lcn6A2AJB9 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lcn6A2AJB9 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lcn6A2AJB9 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lcn6A2AJB9 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lcn6A2AJB9 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lcn6A2AJB9 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lcn6A2AJB9 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lcn6A2AJB9 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lcn6A2AJB9 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lcn6A2AJB9 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lcn6A2AJB9 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lcn6A2AJB9 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lcn6A2AJB9 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lcn6A2AJB9 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lcn6A2AJB9 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lcn6A2AJB9 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lcn6A2AJB9 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lcn6A2AJB9 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lcn6A2AJB9 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lcn6A2AJB9 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Lcn6A2AJB9 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Lcn6A2AJB9 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lcn6A2AJB9 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lcn6A2AJB9 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms