Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB1

Ccdc183, Coiled-coil domain-containing protein 183, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc183A2AJB1 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc183A2AJB1 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc183A2AJB1 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc183A2AJB1 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc183A2AJB1 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc183A2AJB1 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc183A2AJB1 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc183A2AJB1 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc183A2AJB1 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc183A2AJB1 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc183A2AJB1 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc183A2AJB1 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc183A2AJB1 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc183A2AJB1 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc183A2AJB1 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc183A2AJB1 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc183A2AJB1 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc183A2AJB1 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc183A2AJB1 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc183A2AJB1 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc183A2AJB1 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc183A2AJB1 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc183A2AJB1 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc183A2AJB1 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc183A2AJB1 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc183A2AJB1 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc183A2AJB1 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc183A2AJB1 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc183A2AJB1 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc183A2AJB1 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc183A2AJB1 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc183A2AJB1 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc183A2AJB1 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc183A2AJB1 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc183A2AJB1 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc183A2AJB1 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc183A2AJB1 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc183A2AJB1 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc183A2AJB1 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc183A2AJB1 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc183A2AJB1 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc183A2AJB1 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc183A2AJB1 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc183A2AJB1 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc183A2AJB1 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc183A2AJB1 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc183A2AJB1 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc183A2AJB1 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc183A2AJB1 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc183A2AJB1 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc183A2AJB1 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc183A2AJB1 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc183A2AJB1 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc183A2AJB1 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccdc183A2AJB1 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccdc183A2AJB1 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccdc183A2AJB1 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccdc183A2AJB1 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc183A2AJB1 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc183A2AJB1 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc183A2AJB1 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc183A2AJB1 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc183A2AJB1 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc183A2AJB1 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc183A2AJB1 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc183A2AJB1 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc183A2AJB1 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc183A2AJB1 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc183A2AJB1 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc183A2AJB1 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc183A2AJB1 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc183A2AJB1 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc183A2AJB1 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc183A2AJB1 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc183A2AJB1 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc183A2AJB1 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc183A2AJB1 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc183A2AJB1 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc183A2AJB1 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc183A2AJB1 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc183A2AJB1 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc183A2AJB1 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc183A2AJB1 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc183A2AJB1 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc183A2AJB1 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc183A2AJB1 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc183A2AJB1 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc183A2AJB1 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc183A2AJB1 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc183A2AJB1 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc183A2AJB1 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc183A2AJB1 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc183A2AJB1 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc183A2AJB1 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc183A2AJB1 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc183A2AJB1 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc183A2AJB1 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc183A2AJB1 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc183A2AJB1 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc183A2AJB1 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms