Protein–RNA interactions for Protein: A2AEN9

Gm5938, Predicted gene 5938, mousemouse

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Length 163 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5938A2AEN9 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5938A2AEN9 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5938A2AEN9 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5938A2AEN9 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5938A2AEN9 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5938A2AEN9 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5938A2AEN9 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5938A2AEN9 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5938A2AEN9 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5938A2AEN9 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5938A2AEN9 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5938A2AEN9 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5938A2AEN9 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5938A2AEN9 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5938A2AEN9 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5938A2AEN9 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5938A2AEN9 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5938A2AEN9 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5938A2AEN9 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5938A2AEN9 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5938A2AEN9 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5938A2AEN9 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5938A2AEN9 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5938A2AEN9 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5938A2AEN9 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5938A2AEN9 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5938A2AEN9 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5938A2AEN9 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5938A2AEN9 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5938A2AEN9 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5938A2AEN9 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5938A2AEN9 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5938A2AEN9 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5938A2AEN9 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5938A2AEN9 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Gm5938A2AEN9 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5938A2AEN9 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5938A2AEN9 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Gm5938A2AEN9 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5938A2AEN9 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5938A2AEN9 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Gm5938A2AEN9 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5938A2AEN9 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5938A2AEN9 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5938A2AEN9 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Gm5938A2AEN9 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5938A2AEN9 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Gm5938A2AEN9 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5938A2AEN9 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5938A2AEN9 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5938A2AEN9 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Gm5938A2AEN9 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5938A2AEN9 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5938A2AEN9 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5938A2AEN9 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5938A2AEN9 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5938A2AEN9 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5938A2AEN9 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5938A2AEN9 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5938A2AEN9 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5938A2AEN9 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5938A2AEN9 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5938A2AEN9 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5938A2AEN9 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5938A2AEN9 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5938A2AEN9 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5938A2AEN9 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5938A2AEN9 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5938A2AEN9 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5938A2AEN9 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5938A2AEN9 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5938A2AEN9 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5938A2AEN9 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms