Protein–RNA interactions for Protein: A2A935

Prdm16, PR domain zinc finger protein 16, mousemouse

Predictions only

Length 1,275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm16A2A935 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prdm16A2A935 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prdm16A2A935 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prdm16A2A935 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prdm16A2A935 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prdm16A2A935 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prdm16A2A935 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prdm16A2A935 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prdm16A2A935 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prdm16A2A935 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prdm16A2A935 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prdm16A2A935 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prdm16A2A935 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prdm16A2A935 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Prdm16A2A935 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prdm16A2A935 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prdm16A2A935 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prdm16A2A935 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Prdm16A2A935 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prdm16A2A935 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prdm16A2A935 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prdm16A2A935 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prdm16A2A935 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prdm16A2A935 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prdm16A2A935 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prdm16A2A935 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prdm16A2A935 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prdm16A2A935 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prdm16A2A935 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prdm16A2A935 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prdm16A2A935 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prdm16A2A935 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prdm16A2A935 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prdm16A2A935 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prdm16A2A935 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prdm16A2A935 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prdm16A2A935 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prdm16A2A935 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prdm16A2A935 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prdm16A2A935 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prdm16A2A935 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prdm16A2A935 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prdm16A2A935 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prdm16A2A935 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prdm16A2A935 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Prdm16A2A935 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Prdm16A2A935 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Prdm16A2A935 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prdm16A2A935 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prdm16A2A935 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prdm16A2A935 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prdm16A2A935 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prdm16A2A935 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prdm16A2A935 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prdm16A2A935 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prdm16A2A935 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prdm16A2A935 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prdm16A2A935 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prdm16A2A935 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prdm16A2A935 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Prdm16A2A935 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prdm16A2A935 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Prdm16A2A935 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prdm16A2A935 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Prdm16A2A935 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prdm16A2A935 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prdm16A2A935 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prdm16A2A935 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prdm16A2A935 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prdm16A2A935 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prdm16A2A935 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prdm16A2A935 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prdm16A2A935 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Prdm16A2A935 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prdm16A2A935 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prdm16A2A935 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prdm16A2A935 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Prdm16A2A935 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prdm16A2A935 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prdm16A2A935 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prdm16A2A935 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prdm16A2A935 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prdm16A2A935 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prdm16A2A935 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prdm16A2A935 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prdm16A2A935 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prdm16A2A935 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prdm16A2A935 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prdm16A2A935 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prdm16A2A935 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prdm16A2A935 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prdm16A2A935 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prdm16A2A935 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prdm16A2A935 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prdm16A2A935 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prdm16A2A935 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prdm16A2A935 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prdm16A2A935 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Prdm16A2A935 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prdm16A2A935 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
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