Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PtprfA2A8L5 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PtprfA2A8L5 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PtprfA2A8L5 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PtprfA2A8L5 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PtprfA2A8L5 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
PtprfA2A8L5 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PtprfA2A8L5 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
PtprfA2A8L5 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PtprfA2A8L5 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PtprfA2A8L5 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PtprfA2A8L5 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PtprfA2A8L5 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PtprfA2A8L5 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PtprfA2A8L5 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PtprfA2A8L5 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtprfA2A8L5 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtprfA2A8L5 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtprfA2A8L5 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtprfA2A8L5 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtprfA2A8L5 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtprfA2A8L5 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtprfA2A8L5 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtprfA2A8L5 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PtprfA2A8L5 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PtprfA2A8L5 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtprfA2A8L5 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtprfA2A8L5 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtprfA2A8L5 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtprfA2A8L5 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtprfA2A8L5 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtprfA2A8L5 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtprfA2A8L5 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtprfA2A8L5 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtprfA2A8L5 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtprfA2A8L5 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtprfA2A8L5 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtprfA2A8L5 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtprfA2A8L5 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtprfA2A8L5 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtprfA2A8L5 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtprfA2A8L5 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtprfA2A8L5 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtprfA2A8L5 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtprfA2A8L5 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtprfA2A8L5 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtprfA2A8L5 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtprfA2A8L5 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtprfA2A8L5 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtprfA2A8L5 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtprfA2A8L5 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtprfA2A8L5 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtprfA2A8L5 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtprfA2A8L5 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtprfA2A8L5 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtprfA2A8L5 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtprfA2A8L5 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtprfA2A8L5 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtprfA2A8L5 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtprfA2A8L5 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtprfA2A8L5 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtprfA2A8L5 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtprfA2A8L5 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtprfA2A8L5 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtprfA2A8L5 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtprfA2A8L5 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtprfA2A8L5 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtprfA2A8L5 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtprfA2A8L5 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtprfA2A8L5 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtprfA2A8L5 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtprfA2A8L5 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtprfA2A8L5 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtprfA2A8L5 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtprfA2A8L5 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtprfA2A8L5 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtprfA2A8L5 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtprfA2A8L5 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtprfA2A8L5 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtprfA2A8L5 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtprfA2A8L5 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtprfA2A8L5 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtprfA2A8L5 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtprfA2A8L5 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtprfA2A8L5 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtprfA2A8L5 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtprfA2A8L5 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtprfA2A8L5 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtprfA2A8L5 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtprfA2A8L5 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtprfA2A8L5 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtprfA2A8L5 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PtprfA2A8L5 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtprfA2A8L5 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtprfA2A8L5 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PtprfA2A8L5 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtprfA2A8L5 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtprfA2A8L5 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtprfA2A8L5 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtprfA2A8L5 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms