Protein–RNA interactions for Protein: A2A6H3

Fbxo47, F-box only protein 47, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo47A2A6H3 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fbxo47A2A6H3 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fbxo47A2A6H3 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fbxo47A2A6H3 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fbxo47A2A6H3 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fbxo47A2A6H3 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fbxo47A2A6H3 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fbxo47A2A6H3 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fbxo47A2A6H3 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fbxo47A2A6H3 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fbxo47A2A6H3 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fbxo47A2A6H3 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fbxo47A2A6H3 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fbxo47A2A6H3 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fbxo47A2A6H3 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fbxo47A2A6H3 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fbxo47A2A6H3 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fbxo47A2A6H3 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fbxo47A2A6H3 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fbxo47A2A6H3 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fbxo47A2A6H3 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fbxo47A2A6H3 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fbxo47A2A6H3 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fbxo47A2A6H3 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fbxo47A2A6H3 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fbxo47A2A6H3 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Fbxo47A2A6H3 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fbxo47A2A6H3 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fbxo47A2A6H3 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Fbxo47A2A6H3 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fbxo47A2A6H3 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fbxo47A2A6H3 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fbxo47A2A6H3 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fbxo47A2A6H3 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fbxo47A2A6H3 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fbxo47A2A6H3 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fbxo47A2A6H3 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fbxo47A2A6H3 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fbxo47A2A6H3 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fbxo47A2A6H3 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fbxo47A2A6H3 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fbxo47A2A6H3 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fbxo47A2A6H3 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fbxo47A2A6H3 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fbxo47A2A6H3 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Fbxo47A2A6H3 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fbxo47A2A6H3 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fbxo47A2A6H3 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fbxo47A2A6H3 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fbxo47A2A6H3 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fbxo47A2A6H3 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fbxo47A2A6H3 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Fbxo47A2A6H3 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fbxo47A2A6H3 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fbxo47A2A6H3 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fbxo47A2A6H3 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fbxo47A2A6H3 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fbxo47A2A6H3 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fbxo47A2A6H3 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fbxo47A2A6H3 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fbxo47A2A6H3 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fbxo47A2A6H3 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fbxo47A2A6H3 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Fbxo47A2A6H3 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fbxo47A2A6H3 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fbxo47A2A6H3 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fbxo47A2A6H3 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fbxo47A2A6H3 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fbxo47A2A6H3 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fbxo47A2A6H3 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fbxo47A2A6H3 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fbxo47A2A6H3 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fbxo47A2A6H3 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fbxo47A2A6H3 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fbxo47A2A6H3 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fbxo47A2A6H3 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fbxo47A2A6H3 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fbxo47A2A6H3 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fbxo47A2A6H3 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fbxo47A2A6H3 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fbxo47A2A6H3 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fbxo47A2A6H3 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fbxo47A2A6H3 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fbxo47A2A6H3 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fbxo47A2A6H3 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fbxo47A2A6H3 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fbxo47A2A6H3 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fbxo47A2A6H3 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fbxo47A2A6H3 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Fbxo47A2A6H3 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fbxo47A2A6H3 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fbxo47A2A6H3 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fbxo47A2A6H3 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fbxo47A2A6H3 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fbxo47A2A6H3 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fbxo47A2A6H3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fbxo47A2A6H3 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fbxo47A2A6H3 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fbxo47A2A6H3 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fbxo47A2A6H3 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms