Protein–RNA interactions for Protein: A2A259

Pkd2l1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l1A2A259 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkd2l1A2A259 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkd2l1A2A259 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pkd2l1A2A259 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pkd2l1A2A259 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pkd2l1A2A259 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pkd2l1A2A259 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pkd2l1A2A259 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pkd2l1A2A259 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pkd2l1A2A259 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pkd2l1A2A259 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pkd2l1A2A259 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pkd2l1A2A259 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pkd2l1A2A259 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pkd2l1A2A259 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pkd2l1A2A259 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pkd2l1A2A259 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pkd2l1A2A259 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pkd2l1A2A259 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms