Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RP08

1700028J19Rik, RIKEN cDNA 1700028J19 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
1700028J19RikA0A0U1RP08 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.5 ms