Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YTW6

Scn2a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn2aA0A0J9YTW6 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Scn2aA0A0J9YTW6 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scn2aA0A0J9YTW6 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scn2aA0A0J9YTW6 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scn2aA0A0J9YTW6 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scn2aA0A0J9YTW6 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scn2aA0A0J9YTW6 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scn2aA0A0J9YTW6 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scn2aA0A0J9YTW6 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Scn2aA0A0J9YTW6 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scn2aA0A0J9YTW6 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scn2aA0A0J9YTW6 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scn2aA0A0J9YTW6 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scn2aA0A0J9YTW6 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scn2aA0A0J9YTW6 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scn2aA0A0J9YTW6 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scn2aA0A0J9YTW6 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scn2aA0A0J9YTW6 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scn2aA0A0J9YTW6 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scn2aA0A0J9YTW6 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scn2aA0A0J9YTW6 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Scn2aA0A0J9YTW6 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scn2aA0A0J9YTW6 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scn2aA0A0J9YTW6 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Scn2aA0A0J9YTW6 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Scn2aA0A0J9YTW6 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scn2aA0A0J9YTW6 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scn2aA0A0J9YTW6 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scn2aA0A0J9YTW6 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scn2aA0A0J9YTW6 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scn2aA0A0J9YTW6 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scn2aA0A0J9YTW6 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scn2aA0A0J9YTW6 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scn2aA0A0J9YTW6 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Scn2aA0A0J9YTW6 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scn2aA0A0J9YTW6 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scn2aA0A0J9YTW6 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scn2aA0A0J9YTW6 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Scn2aA0A0J9YTW6 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Scn2aA0A0J9YTW6 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Scn2aA0A0J9YTW6 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Scn2aA0A0J9YTW6 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
Scn2aA0A0J9YTW6 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Scn2aA0A0J9YTW6 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Scn2aA0A0J9YTW6 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Scn2aA0A0J9YTW6 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Scn2aA0A0J9YTW6 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Scn2aA0A0J9YTW6 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Scn2aA0A0J9YTW6 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Scn2aA0A0J9YTW6 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Scn2aA0A0J9YTW6 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scn2aA0A0J9YTW6 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scn2aA0A0J9YTW6 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scn2aA0A0J9YTW6 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scn2aA0A0J9YTW6 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Scn2aA0A0J9YTW6 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Scn2aA0A0J9YTW6 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Scn2aA0A0J9YTW6 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scn2aA0A0J9YTW6 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scn2aA0A0J9YTW6 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scn2aA0A0J9YTW6 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Scn2aA0A0J9YTW6 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Scn2aA0A0J9YTW6 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scn2aA0A0J9YTW6 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Scn2aA0A0J9YTW6 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Scn2aA0A0J9YTW6 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Scn2aA0A0J9YTW6 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scn2aA0A0J9YTW6 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scn2aA0A0J9YTW6 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scn2aA0A0J9YTW6 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scn2aA0A0J9YTW6 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Scn2aA0A0J9YTW6 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scn2aA0A0J9YTW6 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scn2aA0A0J9YTW6 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Scn2aA0A0J9YTW6 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Scn2aA0A0J9YTW6 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scn2aA0A0J9YTW6 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scn2aA0A0J9YTW6 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scn2aA0A0J9YTW6 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scn2aA0A0J9YTW6 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scn2aA0A0J9YTW6 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scn2aA0A0J9YTW6 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Scn2aA0A0J9YTW6 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Scn2aA0A0J9YTW6 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scn2aA0A0J9YTW6 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scn2aA0A0J9YTW6 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Scn2aA0A0J9YTW6 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scn2aA0A0J9YTW6 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Scn2aA0A0J9YTW6 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Scn2aA0A0J9YTW6 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Scn2aA0A0J9YTW6 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Scn2aA0A0J9YTW6 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Scn2aA0A0J9YTW6 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Scn2aA0A0J9YTW6 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms