Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 ATM-203ENST00000452508 12954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 AP001350.1-201ENST00000601906 1524 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 MME-211ENST00000492661 2854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 KCNJ16-203ENST00000392671 3981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 CEP170P1-201ENST00000502249 4587 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 SNORD65.1-201ENST00000390889 71 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 AL590705.3-201ENST00000416066 474 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 AC093157.1-203ENST00000416329 713 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 AC068533.1-201ENST00000418542 415 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 MTCO3P1-205ENST00000422088 832 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 OSTCP5-201ENST00000425293 453 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 RAC1P8-201ENST00000427086 527 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 AC097713.2-201ENST00000430199 356 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 SEPT7P5-201ENST00000434048 306 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 AL589935.1-218ENST00000434683 529 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 HMGB3P6-201ENST00000444896 598 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 DNAJC19P1-201ENST00000455312 319 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 LINC01510-203ENST00000458082 626 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 AL136126.1-201ENST00000473603 402 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 OR5H5P-201ENST00000503164 928 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 LINC01957-201ENST00000506392 751 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 MTCO3P44-201ENST00000510977 541 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 SNORA48.10-201ENST00000516965 160 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 RNU4ATAC10P-201ENST00000516967 122 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 RNU6-1073P-201ENST00000517182 106 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 LINC01932-201ENST00000520323 573 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 TMEM68-214ENST00000523073 536 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 AC025437.3-201ENST00000523178 771 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 AP001636.2-201ENST00000525517 696 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 AC063947.1-201ENST00000549036 557 ntTSL 4 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 AC079203.2-201ENST00000559867 387 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 AC107954.1-201ENST00000565906 727 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 MIR3912-201ENST00000577566 105 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 MIR4738-201ENST00000579134 87 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 AC119674.1-207ENST00000641355 633 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 CD36-221ENST00000534394 1741 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 NAIP-205ENST00000508426 4153 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 ZNF404-201ENST00000324394 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 KRTAP27-1-201ENST00000382835 682 ntAPPRIS P1 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 RNU6-730P-201ENST00000383954 104 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 RPL17P50-201ENST00000396131 546 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 Z75741.2-201ENST00000417272 1167 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 AC007161.1-201ENST00000418534 1061 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 LINC02263-202ENST00000420701 597 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 AL078590.2-202ENST00000422736 568 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 GTF2IP23-201ENST00000423746 351 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 AC093155.1-201ENST00000440164 826 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 MTCO1P53-201ENST00000441633 699 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 ARL13A-202ENST00000450049 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 MTUS2-AS2-203ENST00000452602 651 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 PNPLA4P1-201ENST00000458328 305 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 AL034349.1-201ENST00000458367 549 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 AC010401.1-201ENST00000463867 348 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 AC087312.1-201ENST00000471411 480 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 SYPL1P1-201ENST00000473622 768 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 RNA5SP208-201ENST00000516156 78 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 AC027309.2-201ENST00000520566 192 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 LINCR-0001-203ENST00000524047 545 ntTSL 4 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 ZKSCAN7P1-201ENST00000543668 673 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 JKAMP-212ENST00000556985 592 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 AC090771.2-201ENST00000588794 571 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 AC024603.1-201ENST00000597938 592 ntTSL 4 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 AC025588.3-201ENST00000604182 274 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 ADPRM-204ENST00000609540 1138 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 AC090116.1-201ENST00000615679 446 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 AC010975.3-201ENST00000618727 978 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 AL590240.3-201ENST00000621416 943 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 AC010733.2-201ENST00000589496 5702 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 CYYR1-AS1-201ENST00000357401 3412 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 Z99496.1-201ENST00000469424 1477 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 TET2-204ENST00000413648 4973 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.85
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