Protein–RNA interactions for Protein: T1NXB5

Vstm4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm4T1NXB5 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vstm4T1NXB5 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Vstm4T1NXB5 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vstm4T1NXB5 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vstm4T1NXB5 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Vstm4T1NXB5 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vstm4T1NXB5 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vstm4T1NXB5 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vstm4T1NXB5 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vstm4T1NXB5 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vstm4T1NXB5 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vstm4T1NXB5 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vstm4T1NXB5 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Vstm4T1NXB5 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Vstm4T1NXB5 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vstm4T1NXB5 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vstm4T1NXB5 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vstm4T1NXB5 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vstm4T1NXB5 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vstm4T1NXB5 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vstm4T1NXB5 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vstm4T1NXB5 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Vstm4T1NXB5 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vstm4T1NXB5 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vstm4T1NXB5 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vstm4T1NXB5 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vstm4T1NXB5 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vstm4T1NXB5 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vstm4T1NXB5 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vstm4T1NXB5 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vstm4T1NXB5 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vstm4T1NXB5 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vstm4T1NXB5 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vstm4T1NXB5 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vstm4T1NXB5 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vstm4T1NXB5 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vstm4T1NXB5 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vstm4T1NXB5 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vstm4T1NXB5 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vstm4T1NXB5 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vstm4T1NXB5 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vstm4T1NXB5 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vstm4T1NXB5 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vstm4T1NXB5 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vstm4T1NXB5 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Vstm4T1NXB5 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vstm4T1NXB5 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vstm4T1NXB5 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vstm4T1NXB5 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vstm4T1NXB5 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vstm4T1NXB5 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vstm4T1NXB5 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vstm4T1NXB5 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vstm4T1NXB5 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vstm4T1NXB5 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Vstm4T1NXB5 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vstm4T1NXB5 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vstm4T1NXB5 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vstm4T1NXB5 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vstm4T1NXB5 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vstm4T1NXB5 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vstm4T1NXB5 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Vstm4T1NXB5 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vstm4T1NXB5 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vstm4T1NXB5 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Vstm4T1NXB5 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Vstm4T1NXB5 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vstm4T1NXB5 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Vstm4T1NXB5 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vstm4T1NXB5 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vstm4T1NXB5 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vstm4T1NXB5 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vstm4T1NXB5 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vstm4T1NXB5 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vstm4T1NXB5 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vstm4T1NXB5 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Vstm4T1NXB5 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Vstm4T1NXB5 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vstm4T1NXB5 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vstm4T1NXB5 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vstm4T1NXB5 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vstm4T1NXB5 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vstm4T1NXB5 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vstm4T1NXB5 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vstm4T1NXB5 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vstm4T1NXB5 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vstm4T1NXB5 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vstm4T1NXB5 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vstm4T1NXB5 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Vstm4T1NXB5 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vstm4T1NXB5 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vstm4T1NXB5 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vstm4T1NXB5 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vstm4T1NXB5 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vstm4T1NXB5 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Vstm4T1NXB5 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vstm4T1NXB5 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vstm4T1NXB5 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vstm4T1NXB5 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vstm4T1NXB5 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms