Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V9

Ccni, Cyclin-I, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcniQ9Z2V9 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CcniQ9Z2V9 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CcniQ9Z2V9 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CcniQ9Z2V9 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CcniQ9Z2V9 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CcniQ9Z2V9 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CcniQ9Z2V9 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CcniQ9Z2V9 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CcniQ9Z2V9 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CcniQ9Z2V9 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CcniQ9Z2V9 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
CcniQ9Z2V9 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CcniQ9Z2V9 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CcniQ9Z2V9 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CcniQ9Z2V9 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CcniQ9Z2V9 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CcniQ9Z2V9 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CcniQ9Z2V9 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CcniQ9Z2V9 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CcniQ9Z2V9 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CcniQ9Z2V9 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CcniQ9Z2V9 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CcniQ9Z2V9 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CcniQ9Z2V9 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CcniQ9Z2V9 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CcniQ9Z2V9 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CcniQ9Z2V9 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CcniQ9Z2V9 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CcniQ9Z2V9 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CcniQ9Z2V9 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CcniQ9Z2V9 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CcniQ9Z2V9 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CcniQ9Z2V9 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CcniQ9Z2V9 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CcniQ9Z2V9 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CcniQ9Z2V9 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CcniQ9Z2V9 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CcniQ9Z2V9 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CcniQ9Z2V9 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CcniQ9Z2V9 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CcniQ9Z2V9 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CcniQ9Z2V9 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CcniQ9Z2V9 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CcniQ9Z2V9 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CcniQ9Z2V9 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CcniQ9Z2V9 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CcniQ9Z2V9 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CcniQ9Z2V9 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CcniQ9Z2V9 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CcniQ9Z2V9 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CcniQ9Z2V9 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CcniQ9Z2V9 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CcniQ9Z2V9 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CcniQ9Z2V9 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CcniQ9Z2V9 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CcniQ9Z2V9 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CcniQ9Z2V9 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CcniQ9Z2V9 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CcniQ9Z2V9 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CcniQ9Z2V9 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CcniQ9Z2V9 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CcniQ9Z2V9 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CcniQ9Z2V9 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CcniQ9Z2V9 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CcniQ9Z2V9 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CcniQ9Z2V9 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CcniQ9Z2V9 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CcniQ9Z2V9 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CcniQ9Z2V9 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CcniQ9Z2V9 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CcniQ9Z2V9 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CcniQ9Z2V9 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CcniQ9Z2V9 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CcniQ9Z2V9 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CcniQ9Z2V9 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CcniQ9Z2V9 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CcniQ9Z2V9 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CcniQ9Z2V9 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
CcniQ9Z2V9 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CcniQ9Z2V9 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CcniQ9Z2V9 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CcniQ9Z2V9 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CcniQ9Z2V9 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CcniQ9Z2V9 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CcniQ9Z2V9 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CcniQ9Z2V9 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CcniQ9Z2V9 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CcniQ9Z2V9 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CcniQ9Z2V9 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CcniQ9Z2V9 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CcniQ9Z2V9 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CcniQ9Z2V9 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CcniQ9Z2V9 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CcniQ9Z2V9 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CcniQ9Z2V9 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CcniQ9Z2V9 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CcniQ9Z2V9 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CcniQ9Z2V9 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CcniQ9Z2V9 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CcniQ9Z2V9 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms