Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hdac5Q9Z2V6 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hdac5Q9Z2V6 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hdac5Q9Z2V6 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hdac5Q9Z2V6 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hdac5Q9Z2V6 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Hdac5Q9Z2V6 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Hdac5Q9Z2V6 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Hdac5Q9Z2V6 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Hdac5Q9Z2V6 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Hdac5Q9Z2V6 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hdac5Q9Z2V6 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hdac5Q9Z2V6 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hdac5Q9Z2V6 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hdac5Q9Z2V6 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hdac5Q9Z2V6 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hdac5Q9Z2V6 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hdac5Q9Z2V6 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hdac5Q9Z2V6 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hdac5Q9Z2V6 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hdac5Q9Z2V6 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Hdac5Q9Z2V6 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hdac5Q9Z2V6 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hdac5Q9Z2V6 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hdac5Q9Z2V6 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hdac5Q9Z2V6 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hdac5Q9Z2V6 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hdac5Q9Z2V6 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hdac5Q9Z2V6 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hdac5Q9Z2V6 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hdac5Q9Z2V6 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hdac5Q9Z2V6 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hdac5Q9Z2V6 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hdac5Q9Z2V6 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hdac5Q9Z2V6 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hdac5Q9Z2V6 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Hdac5Q9Z2V6 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hdac5Q9Z2V6 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hdac5Q9Z2V6 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hdac5Q9Z2V6 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hdac5Q9Z2V6 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Hdac5Q9Z2V6 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Hdac5Q9Z2V6 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hdac5Q9Z2V6 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hdac5Q9Z2V6 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hdac5Q9Z2V6 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hdac5Q9Z2V6 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hdac5Q9Z2V6 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hdac5Q9Z2V6 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hdac5Q9Z2V6 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hdac5Q9Z2V6 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hdac5Q9Z2V6 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hdac5Q9Z2V6 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hdac5Q9Z2V6 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hdac5Q9Z2V6 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Hdac5Q9Z2V6 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hdac5Q9Z2V6 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hdac5Q9Z2V6 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hdac5Q9Z2V6 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hdac5Q9Z2V6 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Hdac5Q9Z2V6 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Hdac5Q9Z2V6 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Hdac5Q9Z2V6 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hdac5Q9Z2V6 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hdac5Q9Z2V6 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hdac5Q9Z2V6 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hdac5Q9Z2V6 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hdac5Q9Z2V6 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Hdac5Q9Z2V6 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hdac5Q9Z2V6 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hdac5Q9Z2V6 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hdac5Q9Z2V6 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hdac5Q9Z2V6 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Hdac5Q9Z2V6 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Hdac5Q9Z2V6 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hdac5Q9Z2V6 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Hdac5Q9Z2V6 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Hdac5Q9Z2V6 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Hdac5Q9Z2V6 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Hdac5Q9Z2V6 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hdac5Q9Z2V6 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hdac5Q9Z2V6 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hdac5Q9Z2V6 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hdac5Q9Z2V6 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hdac5Q9Z2V6 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hdac5Q9Z2V6 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hdac5Q9Z2V6 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hdac5Q9Z2V6 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hdac5Q9Z2V6 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hdac5Q9Z2V6 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hdac5Q9Z2V6 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hdac5Q9Z2V6 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hdac5Q9Z2V6 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hdac5Q9Z2V6 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hdac5Q9Z2V6 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hdac5Q9Z2V6 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hdac5Q9Z2V6 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hdac5Q9Z2V6 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hdac5Q9Z2V6 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hdac5Q9Z2V6 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
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