Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q5

Mrpl40, 39S ribosomal protein L40, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl40Q9Z2Q5 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Mrpl40Q9Z2Q5 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl40Q9Z2Q5 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms