Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z273

Tulp1, Tubby-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tulp1Q9Z273 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tulp1Q9Z273 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tulp1Q9Z273 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tulp1Q9Z273 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tulp1Q9Z273 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tulp1Q9Z273 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tulp1Q9Z273 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tulp1Q9Z273 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tulp1Q9Z273 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tulp1Q9Z273 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tulp1Q9Z273 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tulp1Q9Z273 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tulp1Q9Z273 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tulp1Q9Z273 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tulp1Q9Z273 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tulp1Q9Z273 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Tulp1Q9Z273 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tulp1Q9Z273 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tulp1Q9Z273 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Tulp1Q9Z273 Gm16973-201ENSMUST00000180682 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tulp1Q9Z273 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tulp1Q9Z273 AC142191.1-201ENSMUST00000219217 699 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tulp1Q9Z273 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tulp1Q9Z273 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tulp1Q9Z273 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tulp1Q9Z273 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tulp1Q9Z273 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tulp1Q9Z273 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tulp1Q9Z273 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tulp1Q9Z273 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tulp1Q9Z273 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tulp1Q9Z273 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tulp1Q9Z273 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tulp1Q9Z273 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tulp1Q9Z273 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tulp1Q9Z273 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tulp1Q9Z273 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tulp1Q9Z273 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tulp1Q9Z273 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tulp1Q9Z273 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tulp1Q9Z273 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Tulp1Q9Z273 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tulp1Q9Z273 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tulp1Q9Z273 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tulp1Q9Z273 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tulp1Q9Z273 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tulp1Q9Z273 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tulp1Q9Z273 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tulp1Q9Z273 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tulp1Q9Z273 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tulp1Q9Z273 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tulp1Q9Z273 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tulp1Q9Z273 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tulp1Q9Z273 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tulp1Q9Z273 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tulp1Q9Z273 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Tulp1Q9Z273 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
Tulp1Q9Z273 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
Tulp1Q9Z273 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Tulp1Q9Z273 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Tulp1Q9Z273 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tulp1Q9Z273 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tulp1Q9Z273 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tulp1Q9Z273 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tulp1Q9Z273 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tulp1Q9Z273 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tulp1Q9Z273 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tulp1Q9Z273 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tulp1Q9Z273 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tulp1Q9Z273 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tulp1Q9Z273 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tulp1Q9Z273 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tulp1Q9Z273 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tulp1Q9Z273 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tulp1Q9Z273 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tulp1Q9Z273 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tulp1Q9Z273 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tulp1Q9Z273 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tulp1Q9Z273 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tulp1Q9Z273 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tulp1Q9Z273 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tulp1Q9Z273 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tulp1Q9Z273 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tulp1Q9Z273 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tulp1Q9Z273 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tulp1Q9Z273 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tulp1Q9Z273 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tulp1Q9Z273 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tulp1Q9Z273 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tulp1Q9Z273 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tulp1Q9Z273 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tulp1Q9Z273 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tulp1Q9Z273 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tulp1Q9Z273 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tulp1Q9Z273 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tulp1Q9Z273 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tulp1Q9Z273 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tulp1Q9Z273 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tulp1Q9Z273 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tulp1Q9Z273 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms