Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z261

Cldn7, Claudin-7, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn7Q9Z261 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn7Q9Z261 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn7Q9Z261 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn7Q9Z261 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn7Q9Z261 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn7Q9Z261 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn7Q9Z261 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn7Q9Z261 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn7Q9Z261 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn7Q9Z261 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn7Q9Z261 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn7Q9Z261 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn7Q9Z261 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn7Q9Z261 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn7Q9Z261 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn7Q9Z261 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn7Q9Z261 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn7Q9Z261 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn7Q9Z261 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn7Q9Z261 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn7Q9Z261 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn7Q9Z261 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn7Q9Z261 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn7Q9Z261 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn7Q9Z261 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn7Q9Z261 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn7Q9Z261 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn7Q9Z261 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn7Q9Z261 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn7Q9Z261 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn7Q9Z261 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn7Q9Z261 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn7Q9Z261 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn7Q9Z261 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn7Q9Z261 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn7Q9Z261 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn7Q9Z261 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn7Q9Z261 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn7Q9Z261 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn7Q9Z261 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn7Q9Z261 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn7Q9Z261 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn7Q9Z261 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn7Q9Z261 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn7Q9Z261 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn7Q9Z261 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn7Q9Z261 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn7Q9Z261 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn7Q9Z261 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn7Q9Z261 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn7Q9Z261 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn7Q9Z261 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn7Q9Z261 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn7Q9Z261 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn7Q9Z261 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn7Q9Z261 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn7Q9Z261 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn7Q9Z261 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn7Q9Z261 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn7Q9Z261 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn7Q9Z261 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn7Q9Z261 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn7Q9Z261 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn7Q9Z261 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn7Q9Z261 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn7Q9Z261 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn7Q9Z261 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn7Q9Z261 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn7Q9Z261 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn7Q9Z261 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn7Q9Z261 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn7Q9Z261 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn7Q9Z261 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cldn7Q9Z261 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn7Q9Z261 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn7Q9Z261 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn7Q9Z261 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn7Q9Z261 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn7Q9Z261 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn7Q9Z261 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn7Q9Z261 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn7Q9Z261 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn7Q9Z261 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn7Q9Z261 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn7Q9Z261 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn7Q9Z261 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn7Q9Z261 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn7Q9Z261 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn7Q9Z261 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn7Q9Z261 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn7Q9Z261 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn7Q9Z261 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn7Q9Z261 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn7Q9Z261 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn7Q9Z261 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn7Q9Z261 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn7Q9Z261 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn7Q9Z261 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn7Q9Z261 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn7Q9Z261 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms