Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Q9

Vars, Valine--tRNA ligase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VarsQ9Z1Q9 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VarsQ9Z1Q9 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
VarsQ9Z1Q9 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
VarsQ9Z1Q9 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
VarsQ9Z1Q9 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VarsQ9Z1Q9 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VarsQ9Z1Q9 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VarsQ9Z1Q9 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VarsQ9Z1Q9 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VarsQ9Z1Q9 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
VarsQ9Z1Q9 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VarsQ9Z1Q9 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VarsQ9Z1Q9 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VarsQ9Z1Q9 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VarsQ9Z1Q9 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VarsQ9Z1Q9 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VarsQ9Z1Q9 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
VarsQ9Z1Q9 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VarsQ9Z1Q9 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VarsQ9Z1Q9 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VarsQ9Z1Q9 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VarsQ9Z1Q9 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VarsQ9Z1Q9 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VarsQ9Z1Q9 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VarsQ9Z1Q9 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VarsQ9Z1Q9 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VarsQ9Z1Q9 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VarsQ9Z1Q9 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VarsQ9Z1Q9 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VarsQ9Z1Q9 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VarsQ9Z1Q9 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VarsQ9Z1Q9 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VarsQ9Z1Q9 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VarsQ9Z1Q9 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VarsQ9Z1Q9 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VarsQ9Z1Q9 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VarsQ9Z1Q9 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VarsQ9Z1Q9 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VarsQ9Z1Q9 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VarsQ9Z1Q9 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VarsQ9Z1Q9 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VarsQ9Z1Q9 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VarsQ9Z1Q9 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VarsQ9Z1Q9 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VarsQ9Z1Q9 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VarsQ9Z1Q9 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VarsQ9Z1Q9 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VarsQ9Z1Q9 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VarsQ9Z1Q9 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VarsQ9Z1Q9 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VarsQ9Z1Q9 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VarsQ9Z1Q9 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VarsQ9Z1Q9 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VarsQ9Z1Q9 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VarsQ9Z1Q9 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VarsQ9Z1Q9 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VarsQ9Z1Q9 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VarsQ9Z1Q9 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
VarsQ9Z1Q9 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VarsQ9Z1Q9 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VarsQ9Z1Q9 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
VarsQ9Z1Q9 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VarsQ9Z1Q9 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VarsQ9Z1Q9 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VarsQ9Z1Q9 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VarsQ9Z1Q9 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VarsQ9Z1Q9 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VarsQ9Z1Q9 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VarsQ9Z1Q9 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VarsQ9Z1Q9 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VarsQ9Z1Q9 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VarsQ9Z1Q9 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VarsQ9Z1Q9 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VarsQ9Z1Q9 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VarsQ9Z1Q9 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VarsQ9Z1Q9 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VarsQ9Z1Q9 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VarsQ9Z1Q9 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VarsQ9Z1Q9 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VarsQ9Z1Q9 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VarsQ9Z1Q9 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VarsQ9Z1Q9 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
VarsQ9Z1Q9 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VarsQ9Z1Q9 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VarsQ9Z1Q9 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VarsQ9Z1Q9 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VarsQ9Z1Q9 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VarsQ9Z1Q9 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VarsQ9Z1Q9 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VarsQ9Z1Q9 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VarsQ9Z1Q9 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VarsQ9Z1Q9 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VarsQ9Z1Q9 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VarsQ9Z1Q9 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VarsQ9Z1Q9 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VarsQ9Z1Q9 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VarsQ9Z1Q9 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VarsQ9Z1Q9 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VarsQ9Z1Q9 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VarsQ9Z1Q9 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms