Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N6

Sfrp4, Secreted frizzled-related sequence protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp4Q9Z1N6 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sfrp4Q9Z1N6 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sfrp4Q9Z1N6 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sfrp4Q9Z1N6 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sfrp4Q9Z1N6 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sfrp4Q9Z1N6 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sfrp4Q9Z1N6 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms