Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1E3

Nfkbia, NF-kappa-B inhibitor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfkbiaQ9Z1E3 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NfkbiaQ9Z1E3 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NfkbiaQ9Z1E3 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NfkbiaQ9Z1E3 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NfkbiaQ9Z1E3 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NfkbiaQ9Z1E3 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NfkbiaQ9Z1E3 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NfkbiaQ9Z1E3 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NfkbiaQ9Z1E3 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NfkbiaQ9Z1E3 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NfkbiaQ9Z1E3 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NfkbiaQ9Z1E3 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NfkbiaQ9Z1E3 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NfkbiaQ9Z1E3 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NfkbiaQ9Z1E3 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NfkbiaQ9Z1E3 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NfkbiaQ9Z1E3 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NfkbiaQ9Z1E3 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NfkbiaQ9Z1E3 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NfkbiaQ9Z1E3 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NfkbiaQ9Z1E3 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NfkbiaQ9Z1E3 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NfkbiaQ9Z1E3 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NfkbiaQ9Z1E3 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NfkbiaQ9Z1E3 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NfkbiaQ9Z1E3 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NfkbiaQ9Z1E3 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NfkbiaQ9Z1E3 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NfkbiaQ9Z1E3 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NfkbiaQ9Z1E3 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NfkbiaQ9Z1E3 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NfkbiaQ9Z1E3 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NfkbiaQ9Z1E3 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NfkbiaQ9Z1E3 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NfkbiaQ9Z1E3 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NfkbiaQ9Z1E3 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NfkbiaQ9Z1E3 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NfkbiaQ9Z1E3 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NfkbiaQ9Z1E3 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NfkbiaQ9Z1E3 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NfkbiaQ9Z1E3 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NfkbiaQ9Z1E3 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NfkbiaQ9Z1E3 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NfkbiaQ9Z1E3 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NfkbiaQ9Z1E3 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NfkbiaQ9Z1E3 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NfkbiaQ9Z1E3 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NfkbiaQ9Z1E3 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NfkbiaQ9Z1E3 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NfkbiaQ9Z1E3 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NfkbiaQ9Z1E3 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NfkbiaQ9Z1E3 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NfkbiaQ9Z1E3 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NfkbiaQ9Z1E3 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NfkbiaQ9Z1E3 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NfkbiaQ9Z1E3 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NfkbiaQ9Z1E3 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NfkbiaQ9Z1E3 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NfkbiaQ9Z1E3 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NfkbiaQ9Z1E3 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NfkbiaQ9Z1E3 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NfkbiaQ9Z1E3 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NfkbiaQ9Z1E3 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NfkbiaQ9Z1E3 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NfkbiaQ9Z1E3 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NfkbiaQ9Z1E3 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NfkbiaQ9Z1E3 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NfkbiaQ9Z1E3 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NfkbiaQ9Z1E3 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NfkbiaQ9Z1E3 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NfkbiaQ9Z1E3 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NfkbiaQ9Z1E3 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NfkbiaQ9Z1E3 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NfkbiaQ9Z1E3 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NfkbiaQ9Z1E3 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NfkbiaQ9Z1E3 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NfkbiaQ9Z1E3 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NfkbiaQ9Z1E3 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NfkbiaQ9Z1E3 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NfkbiaQ9Z1E3 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NfkbiaQ9Z1E3 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NfkbiaQ9Z1E3 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NfkbiaQ9Z1E3 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NfkbiaQ9Z1E3 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NfkbiaQ9Z1E3 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NfkbiaQ9Z1E3 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NfkbiaQ9Z1E3 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NfkbiaQ9Z1E3 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NfkbiaQ9Z1E3 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NfkbiaQ9Z1E3 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NfkbiaQ9Z1E3 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NfkbiaQ9Z1E3 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NfkbiaQ9Z1E3 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NfkbiaQ9Z1E3 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NfkbiaQ9Z1E3 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NfkbiaQ9Z1E3 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NfkbiaQ9Z1E3 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NfkbiaQ9Z1E3 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NfkbiaQ9Z1E3 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NfkbiaQ9Z1E3 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms