Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z140

Cpne6, Copine-6, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne6Q9Z140 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpne6Q9Z140 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpne6Q9Z140 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpne6Q9Z140 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpne6Q9Z140 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpne6Q9Z140 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpne6Q9Z140 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpne6Q9Z140 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpne6Q9Z140 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpne6Q9Z140 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpne6Q9Z140 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpne6Q9Z140 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpne6Q9Z140 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpne6Q9Z140 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpne6Q9Z140 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpne6Q9Z140 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpne6Q9Z140 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpne6Q9Z140 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpne6Q9Z140 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpne6Q9Z140 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpne6Q9Z140 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpne6Q9Z140 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpne6Q9Z140 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpne6Q9Z140 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpne6Q9Z140 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpne6Q9Z140 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpne6Q9Z140 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpne6Q9Z140 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpne6Q9Z140 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpne6Q9Z140 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpne6Q9Z140 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpne6Q9Z140 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpne6Q9Z140 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpne6Q9Z140 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpne6Q9Z140 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpne6Q9Z140 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpne6Q9Z140 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpne6Q9Z140 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpne6Q9Z140 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpne6Q9Z140 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpne6Q9Z140 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpne6Q9Z140 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpne6Q9Z140 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpne6Q9Z140 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpne6Q9Z140 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpne6Q9Z140 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpne6Q9Z140 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpne6Q9Z140 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpne6Q9Z140 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpne6Q9Z140 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpne6Q9Z140 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpne6Q9Z140 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpne6Q9Z140 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpne6Q9Z140 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpne6Q9Z140 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpne6Q9Z140 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpne6Q9Z140 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpne6Q9Z140 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpne6Q9Z140 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpne6Q9Z140 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpne6Q9Z140 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpne6Q9Z140 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpne6Q9Z140 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cpne6Q9Z140 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpne6Q9Z140 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpne6Q9Z140 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpne6Q9Z140 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpne6Q9Z140 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpne6Q9Z140 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpne6Q9Z140 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpne6Q9Z140 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpne6Q9Z140 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpne6Q9Z140 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpne6Q9Z140 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpne6Q9Z140 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpne6Q9Z140 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpne6Q9Z140 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpne6Q9Z140 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpne6Q9Z140 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpne6Q9Z140 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpne6Q9Z140 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpne6Q9Z140 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpne6Q9Z140 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpne6Q9Z140 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpne6Q9Z140 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpne6Q9Z140 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpne6Q9Z140 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpne6Q9Z140 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpne6Q9Z140 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpne6Q9Z140 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpne6Q9Z140 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpne6Q9Z140 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpne6Q9Z140 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpne6Q9Z140 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cpne6Q9Z140 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cpne6Q9Z140 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cpne6Q9Z140 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cpne6Q9Z140 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cpne6Q9Z140 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cpne6Q9Z140 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms