Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E3

Aire, Autoimmune regulator, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AireQ9Z0E3 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
AireQ9Z0E3 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
AireQ9Z0E3 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
AireQ9Z0E3 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
AireQ9Z0E3 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
AireQ9Z0E3 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AireQ9Z0E3 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AireQ9Z0E3 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AireQ9Z0E3 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
AireQ9Z0E3 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AireQ9Z0E3 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AireQ9Z0E3 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AireQ9Z0E3 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AireQ9Z0E3 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AireQ9Z0E3 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AireQ9Z0E3 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
AireQ9Z0E3 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
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