Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVP6

Papolb, Poly(A) polymerase beta, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PapolbQ9WVP6 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PapolbQ9WVP6 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PapolbQ9WVP6 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PapolbQ9WVP6 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PapolbQ9WVP6 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PapolbQ9WVP6 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PapolbQ9WVP6 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PapolbQ9WVP6 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PapolbQ9WVP6 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PapolbQ9WVP6 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PapolbQ9WVP6 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PapolbQ9WVP6 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PapolbQ9WVP6 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PapolbQ9WVP6 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PapolbQ9WVP6 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PapolbQ9WVP6 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PapolbQ9WVP6 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PapolbQ9WVP6 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PapolbQ9WVP6 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PapolbQ9WVP6 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PapolbQ9WVP6 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PapolbQ9WVP6 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PapolbQ9WVP6 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PapolbQ9WVP6 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PapolbQ9WVP6 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PapolbQ9WVP6 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PapolbQ9WVP6 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PapolbQ9WVP6 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PapolbQ9WVP6 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PapolbQ9WVP6 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PapolbQ9WVP6 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PapolbQ9WVP6 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PapolbQ9WVP6 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PapolbQ9WVP6 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PapolbQ9WVP6 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PapolbQ9WVP6 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PapolbQ9WVP6 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PapolbQ9WVP6 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PapolbQ9WVP6 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PapolbQ9WVP6 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PapolbQ9WVP6 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PapolbQ9WVP6 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PapolbQ9WVP6 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PapolbQ9WVP6 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PapolbQ9WVP6 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PapolbQ9WVP6 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PapolbQ9WVP6 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PapolbQ9WVP6 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PapolbQ9WVP6 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PapolbQ9WVP6 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PapolbQ9WVP6 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PapolbQ9WVP6 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PapolbQ9WVP6 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PapolbQ9WVP6 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PapolbQ9WVP6 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PapolbQ9WVP6 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PapolbQ9WVP6 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PapolbQ9WVP6 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PapolbQ9WVP6 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PapolbQ9WVP6 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PapolbQ9WVP6 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PapolbQ9WVP6 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PapolbQ9WVP6 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PapolbQ9WVP6 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PapolbQ9WVP6 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PapolbQ9WVP6 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PapolbQ9WVP6 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PapolbQ9WVP6 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PapolbQ9WVP6 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PapolbQ9WVP6 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PapolbQ9WVP6 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PapolbQ9WVP6 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PapolbQ9WVP6 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PapolbQ9WVP6 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PapolbQ9WVP6 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PapolbQ9WVP6 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PapolbQ9WVP6 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PapolbQ9WVP6 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PapolbQ9WVP6 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PapolbQ9WVP6 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PapolbQ9WVP6 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PapolbQ9WVP6 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PapolbQ9WVP6 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PapolbQ9WVP6 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PapolbQ9WVP6 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PapolbQ9WVP6 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PapolbQ9WVP6 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PapolbQ9WVP6 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PapolbQ9WVP6 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PapolbQ9WVP6 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PapolbQ9WVP6 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PapolbQ9WVP6 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PapolbQ9WVP6 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PapolbQ9WVP6 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PapolbQ9WVP6 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PapolbQ9WVP6 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PapolbQ9WVP6 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PapolbQ9WVP6 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PapolbQ9WVP6 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PapolbQ9WVP6 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms