Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUH2

Lhx9, LIM/homeobox protein Lhx9, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx9Q9WUH2 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lhx9Q9WUH2 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lhx9Q9WUH2 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lhx9Q9WUH2 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lhx9Q9WUH2 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lhx9Q9WUH2 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lhx9Q9WUH2 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lhx9Q9WUH2 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhx9Q9WUH2 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhx9Q9WUH2 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhx9Q9WUH2 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhx9Q9WUH2 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhx9Q9WUH2 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhx9Q9WUH2 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhx9Q9WUH2 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhx9Q9WUH2 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhx9Q9WUH2 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhx9Q9WUH2 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhx9Q9WUH2 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhx9Q9WUH2 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhx9Q9WUH2 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhx9Q9WUH2 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhx9Q9WUH2 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhx9Q9WUH2 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhx9Q9WUH2 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhx9Q9WUH2 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhx9Q9WUH2 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhx9Q9WUH2 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lhx9Q9WUH2 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lhx9Q9WUH2 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lhx9Q9WUH2 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lhx9Q9WUH2 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lhx9Q9WUH2 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lhx9Q9WUH2 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lhx9Q9WUH2 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lhx9Q9WUH2 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lhx9Q9WUH2 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lhx9Q9WUH2 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lhx9Q9WUH2 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lhx9Q9WUH2 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lhx9Q9WUH2 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lhx9Q9WUH2 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lhx9Q9WUH2 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lhx9Q9WUH2 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lhx9Q9WUH2 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lhx9Q9WUH2 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lhx9Q9WUH2 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lhx9Q9WUH2 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lhx9Q9WUH2 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lhx9Q9WUH2 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lhx9Q9WUH2 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lhx9Q9WUH2 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lhx9Q9WUH2 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lhx9Q9WUH2 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lhx9Q9WUH2 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lhx9Q9WUH2 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lhx9Q9WUH2 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lhx9Q9WUH2 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lhx9Q9WUH2 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lhx9Q9WUH2 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lhx9Q9WUH2 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lhx9Q9WUH2 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lhx9Q9WUH2 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lhx9Q9WUH2 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lhx9Q9WUH2 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lhx9Q9WUH2 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lhx9Q9WUH2 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lhx9Q9WUH2 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lhx9Q9WUH2 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lhx9Q9WUH2 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lhx9Q9WUH2 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lhx9Q9WUH2 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lhx9Q9WUH2 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lhx9Q9WUH2 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lhx9Q9WUH2 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lhx9Q9WUH2 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lhx9Q9WUH2 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lhx9Q9WUH2 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lhx9Q9WUH2 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lhx9Q9WUH2 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lhx9Q9WUH2 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Lhx9Q9WUH2 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lhx9Q9WUH2 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lhx9Q9WUH2 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lhx9Q9WUH2 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lhx9Q9WUH2 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lhx9Q9WUH2 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lhx9Q9WUH2 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lhx9Q9WUH2 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lhx9Q9WUH2 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lhx9Q9WUH2 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lhx9Q9WUH2 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lhx9Q9WUH2 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lhx9Q9WUH2 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lhx9Q9WUH2 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lhx9Q9WUH2 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lhx9Q9WUH2 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lhx9Q9WUH2 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lhx9Q9WUH2 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lhx9Q9WUH2 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms