Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU38

Scnn1b, Amiloride-sensitive sodium channel subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scnn1bQ9WU38 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scnn1bQ9WU38 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scnn1bQ9WU38 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scnn1bQ9WU38 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scnn1bQ9WU38 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scnn1bQ9WU38 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scnn1bQ9WU38 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scnn1bQ9WU38 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scnn1bQ9WU38 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Scnn1bQ9WU38 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scnn1bQ9WU38 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scnn1bQ9WU38 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scnn1bQ9WU38 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scnn1bQ9WU38 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scnn1bQ9WU38 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scnn1bQ9WU38 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scnn1bQ9WU38 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scnn1bQ9WU38 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scnn1bQ9WU38 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scnn1bQ9WU38 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scnn1bQ9WU38 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scnn1bQ9WU38 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scnn1bQ9WU38 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scnn1bQ9WU38 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scnn1bQ9WU38 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scnn1bQ9WU38 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scnn1bQ9WU38 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scnn1bQ9WU38 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scnn1bQ9WU38 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scnn1bQ9WU38 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scnn1bQ9WU38 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Scnn1bQ9WU38 Klra4-201ENSMUST00000119096 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scnn1bQ9WU38 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Scnn1bQ9WU38 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Scnn1bQ9WU38 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scnn1bQ9WU38 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Scnn1bQ9WU38 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scnn1bQ9WU38 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Scnn1bQ9WU38 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Scnn1bQ9WU38 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scnn1bQ9WU38 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scnn1bQ9WU38 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scnn1bQ9WU38 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Scnn1bQ9WU38 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scnn1bQ9WU38 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scnn1bQ9WU38 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scnn1bQ9WU38 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scnn1bQ9WU38 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scnn1bQ9WU38 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scnn1bQ9WU38 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scnn1bQ9WU38 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scnn1bQ9WU38 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scnn1bQ9WU38 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scnn1bQ9WU38 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scnn1bQ9WU38 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scnn1bQ9WU38 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Scnn1bQ9WU38 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scnn1bQ9WU38 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scnn1bQ9WU38 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scnn1bQ9WU38 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scnn1bQ9WU38 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Scnn1bQ9WU38 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scnn1bQ9WU38 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scnn1bQ9WU38 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scnn1bQ9WU38 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scnn1bQ9WU38 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scnn1bQ9WU38 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scnn1bQ9WU38 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scnn1bQ9WU38 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scnn1bQ9WU38 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scnn1bQ9WU38 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scnn1bQ9WU38 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scnn1bQ9WU38 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scnn1bQ9WU38 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scnn1bQ9WU38 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scnn1bQ9WU38 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scnn1bQ9WU38 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scnn1bQ9WU38 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scnn1bQ9WU38 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scnn1bQ9WU38 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Scnn1bQ9WU38 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scnn1bQ9WU38 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Scnn1bQ9WU38 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scnn1bQ9WU38 Thoc7-209ENSMUST00000225325 765 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Scnn1bQ9WU38 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scnn1bQ9WU38 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scnn1bQ9WU38 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scnn1bQ9WU38 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scnn1bQ9WU38 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scnn1bQ9WU38 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scnn1bQ9WU38 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scnn1bQ9WU38 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Scnn1bQ9WU38 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Scnn1bQ9WU38 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Scnn1bQ9WU38 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Scnn1bQ9WU38 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Scnn1bQ9WU38 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Scnn1bQ9WU38 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Scnn1bQ9WU38 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Scnn1bQ9WU38 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms