Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX2

Prkra, Interferon-inducible double-stranded RNA-dependent protein kinase activator A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkraQ9WTX2 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrkraQ9WTX2 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrkraQ9WTX2 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrkraQ9WTX2 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrkraQ9WTX2 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrkraQ9WTX2 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrkraQ9WTX2 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrkraQ9WTX2 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrkraQ9WTX2 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrkraQ9WTX2 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrkraQ9WTX2 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrkraQ9WTX2 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrkraQ9WTX2 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrkraQ9WTX2 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrkraQ9WTX2 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrkraQ9WTX2 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrkraQ9WTX2 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrkraQ9WTX2 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrkraQ9WTX2 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrkraQ9WTX2 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrkraQ9WTX2 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrkraQ9WTX2 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrkraQ9WTX2 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrkraQ9WTX2 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrkraQ9WTX2 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrkraQ9WTX2 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrkraQ9WTX2 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrkraQ9WTX2 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrkraQ9WTX2 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrkraQ9WTX2 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrkraQ9WTX2 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrkraQ9WTX2 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrkraQ9WTX2 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrkraQ9WTX2 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrkraQ9WTX2 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrkraQ9WTX2 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrkraQ9WTX2 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PrkraQ9WTX2 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrkraQ9WTX2 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrkraQ9WTX2 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrkraQ9WTX2 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrkraQ9WTX2 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrkraQ9WTX2 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrkraQ9WTX2 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrkraQ9WTX2 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrkraQ9WTX2 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrkraQ9WTX2 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrkraQ9WTX2 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrkraQ9WTX2 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrkraQ9WTX2 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrkraQ9WTX2 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrkraQ9WTX2 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrkraQ9WTX2 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrkraQ9WTX2 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrkraQ9WTX2 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrkraQ9WTX2 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrkraQ9WTX2 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PrkraQ9WTX2 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PrkraQ9WTX2 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrkraQ9WTX2 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrkraQ9WTX2 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrkraQ9WTX2 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrkraQ9WTX2 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PrkraQ9WTX2 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PrkraQ9WTX2 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PrkraQ9WTX2 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PrkraQ9WTX2 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PrkraQ9WTX2 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrkraQ9WTX2 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrkraQ9WTX2 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrkraQ9WTX2 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrkraQ9WTX2 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrkraQ9WTX2 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrkraQ9WTX2 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrkraQ9WTX2 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrkraQ9WTX2 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrkraQ9WTX2 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrkraQ9WTX2 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrkraQ9WTX2 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrkraQ9WTX2 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PrkraQ9WTX2 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrkraQ9WTX2 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrkraQ9WTX2 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrkraQ9WTX2 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrkraQ9WTX2 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PrkraQ9WTX2 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PrkraQ9WTX2 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrkraQ9WTX2 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PrkraQ9WTX2 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrkraQ9WTX2 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrkraQ9WTX2 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrkraQ9WTX2 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrkraQ9WTX2 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrkraQ9WTX2 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrkraQ9WTX2 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrkraQ9WTX2 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrkraQ9WTX2 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrkraQ9WTX2 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PrkraQ9WTX2 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrkraQ9WTX2 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms