Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTU3

Scn8a, Sodium channel protein type 8 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,978 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn8aQ9WTU3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scn8aQ9WTU3 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scn8aQ9WTU3 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scn8aQ9WTU3 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scn8aQ9WTU3 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scn8aQ9WTU3 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scn8aQ9WTU3 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scn8aQ9WTU3 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scn8aQ9WTU3 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Scn8aQ9WTU3 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scn8aQ9WTU3 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scn8aQ9WTU3 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scn8aQ9WTU3 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Scn8aQ9WTU3 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Scn8aQ9WTU3 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scn8aQ9WTU3 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scn8aQ9WTU3 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scn8aQ9WTU3 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scn8aQ9WTU3 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scn8aQ9WTU3 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scn8aQ9WTU3 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scn8aQ9WTU3 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scn8aQ9WTU3 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scn8aQ9WTU3 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scn8aQ9WTU3 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scn8aQ9WTU3 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scn8aQ9WTU3 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scn8aQ9WTU3 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scn8aQ9WTU3 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scn8aQ9WTU3 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scn8aQ9WTU3 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scn8aQ9WTU3 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Scn8aQ9WTU3 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scn8aQ9WTU3 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scn8aQ9WTU3 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scn8aQ9WTU3 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scn8aQ9WTU3 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scn8aQ9WTU3 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scn8aQ9WTU3 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scn8aQ9WTU3 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scn8aQ9WTU3 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scn8aQ9WTU3 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scn8aQ9WTU3 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scn8aQ9WTU3 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scn8aQ9WTU3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scn8aQ9WTU3 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scn8aQ9WTU3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scn8aQ9WTU3 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scn8aQ9WTU3 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scn8aQ9WTU3 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scn8aQ9WTU3 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scn8aQ9WTU3 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scn8aQ9WTU3 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scn8aQ9WTU3 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scn8aQ9WTU3 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scn8aQ9WTU3 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Scn8aQ9WTU3 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scn8aQ9WTU3 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scn8aQ9WTU3 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scn8aQ9WTU3 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scn8aQ9WTU3 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scn8aQ9WTU3 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scn8aQ9WTU3 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scn8aQ9WTU3 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scn8aQ9WTU3 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scn8aQ9WTU3 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scn8aQ9WTU3 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scn8aQ9WTU3 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scn8aQ9WTU3 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scn8aQ9WTU3 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scn8aQ9WTU3 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scn8aQ9WTU3 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scn8aQ9WTU3 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scn8aQ9WTU3 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scn8aQ9WTU3 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scn8aQ9WTU3 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Scn8aQ9WTU3 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scn8aQ9WTU3 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scn8aQ9WTU3 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scn8aQ9WTU3 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scn8aQ9WTU3 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scn8aQ9WTU3 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Scn8aQ9WTU3 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scn8aQ9WTU3 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scn8aQ9WTU3 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scn8aQ9WTU3 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scn8aQ9WTU3 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scn8aQ9WTU3 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scn8aQ9WTU3 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scn8aQ9WTU3 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scn8aQ9WTU3 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scn8aQ9WTU3 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scn8aQ9WTU3 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scn8aQ9WTU3 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scn8aQ9WTU3 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scn8aQ9WTU3 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Scn8aQ9WTU3 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scn8aQ9WTU3 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scn8aQ9WTU3 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scn8aQ9WTU3 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms